如果有後遺症，那麼員工是需要申請勞動能力鑑定（傷殘鑑定）根據傷殘等級來計算賠償。

依據《工傷保險條例》第二十一條　職工發生工傷，經治療傷情相對穩定後存在殘疾、影響勞動能力的，應當進行勞動能力鑑定。

《社會保險法》

第三十八條 因工傷發生的下列費用，按照國家規定從工傷保險基金中支付：

（一）治療工傷的醫療費用和康復費用；

（二）住院伙食補助費；

（三）到統籌地區以外就醫的交通食宿費；

（四）安裝配置傷殘輔助器具所需費用；

（五）生活不能自理的，經勞動能力鑑定委員會確認的生活護理費；

（六）一次性傷殘補助金和一至四級傷殘職工按月領取的傷殘津貼；

（七）終止或者解除勞動合同時，應當享受的一次性醫療補助金；

（八）因工死亡的，其遺屬領取的喪葬補助金、供養親屬撫卹金和因工死亡補助金；

（九）勞動能力鑑定費。

第三十九條 因工傷發生的下列費用，按照國家規定由用人單位支付：

（一）治療工傷期間的工資福利；

（二）五級、六級傷殘職工按月領取的傷殘津貼；

（三）終止或者解除勞動合同時，應當享受的一次性傷殘就業補助金。