頭孢噻肟鈉不在國家基本藥物目錄中，因此不是基本藥物。

頭孢噻肟鈉屬於第三代頭孢菌素，與頭孢曲松，頭孢唑肟，頭孢哌酮，頭孢他啶等屬於同一類藥物。對以革蘭陰性菌為主要致病菌的感染性疾病如泌尿系感染，消化道感染，腹腔盆腔感染均有較好的效果，對以肺炎鏈球菌，溶血性鏈球菌等革蘭陽性菌導致的扁桃體炎，支氣管炎，肺炎等感染，遜色於一二代頭孢頭孢菌素如頭孢拉定，頭孢呋辛。

國家基本藥物是指收錄進由國家政府制定的《國家基本藥物目錄》中的藥品，國家基本藥物這個概念是由世界衛生組織提出的，針對世界不發達地區和發展中國家醫藥資源不足，醫保體系不夠健全的現狀而提出的，目的是為了滿足公民疾病防治過程中最基本，必需的，不可缺少的藥品。基本藥物應具有可獲得性以及可承受性，也就是說應該供應充足，價格適中。基本藥品遴選原則是防治必須，安全有效，價格合理，使用方便，臨床首選和基層能夠配備的原則。國家基本藥物一般每3年一更新，目前在用的是2018年版本，2015年版的國家基本藥物目錄中收錄了頭孢噻肟鈉，但是在2018版目錄中剔除了頭孢噻肟鈉，因此頭孢噻肟鈉不是國家基本藥物。

頭孢噻肟雖然與頭孢曲松同屬於第三代頭孢菌素，但是與頭孢曲松比較，對耐青黴素的肺炎鏈球菌的抗菌活性不如前者，且頭孢曲松只需一天給藥一次，而頭孢噻肟需要每天2-3次給藥，在給藥便捷性上不如頭孢曲松，與頭孢他啶比較，對銅綠假單胞菌的抗菌活性不如頭孢他啶。