明朝衛所軍官（如千戶、百戶等）與把總、千總、守備、參將、總兵等武官分別隸屬於衛所制和營兵制，兩者之間並不存在明顯交叉。

1、衛所制

衛所，是明朝使用的一種軍隊編制制度，永樂時全國兵員達兩百萬 。明朝軍隊編制實行“衛所制”。軍隊組織有衛、所兩級。一府設所，幾府設衛。衛設指揮使，統兵士五千六百人。

軍隊組織有衛、所兩級。一府設所，幾府設衛。衛設指揮使，統兵士五千六百人。衛下有千戶所（一千一百二十士兵），千戶所下設百戶所（一百一十二士兵）。

各府縣衛所歸各指揮使司都指揮使管轄，各都指揮使又歸中央五軍都督府管轄。京都的衛軍分兩種：一是京軍三大營，為全國軍隊的精銳；二是皇帝親軍，前者歸五軍都督府管，後者常由太監統領直接聽令於皇帝。

兵士有軍籍，世襲為軍，平時屯田或駐防。遇有戰爭，朝廷命將，率領調自衛、所計程車兵征戰。衛所制有些像世兵制，又與唐代的府兵制相似。

2、營兵制

明朝軍隊大致又可分為京軍和地方軍，京軍就是守衛京師的軍隊，地方軍包括了衛軍、邊兵和民兵，邊兵一般就是指守衛邊疆的軍隊，在明朝有九個軍鎮，史稱“九邊”。邊兵和民兵又隸屬另一個系統，稱之為營兵制。

由於衛所官調任為營官很普遍，衛所官職中的都指揮使司一職，為營制借用。衛所制中的都指揮使司，為地方衛所的最高官員。

但都司一職作為營官，職別則相當低，僅高於守備一級。在總、副、參、遊以下。來自於都司中的營官，被革職後，即回到原衛所。

營兵軍官由什長、隊長、哨官、守備、都司、遊擊、參將、副總兵和總兵組成，兵將一般都不世襲，也不會終身服役，軍隊供應則全部由朝廷提供，因此募兵制給朝廷帶來了不少的壓力。