直線制是最簡單的專案管理組織形式，這種形式不可能無限制地擴充套件。所以隨著組織規模的擴大，原來那種單純的直線制的方式無法再維繫機構的運作，這就需要藉助各方面專門的人才來打理事業。由財務人才構成了財務部門，由新產品開發人才構成了新產品開發部門，由營銷人才構成了營銷部門，由生產人才構成了生產部門，他們都是本領域的專家。他們的活動集中在某一個特定的部門，顯然這是一種專業化分工的方式，是一種按照職能來劃分部門的方式，這種形式就叫職能制組織結構。一般來說，對於絕大多數的中小型組織，它是一種普遍應用的選擇。

直線-職能型組織結構比直線型組織結構具有優越性。它既保持了直線型結構集中統一指揮的優點，又吸收了職能型結構分工細密、注重專業化管理的長處，從而有助於提高管理工作的效率。

　　直線-職能型組織結構的內在缺陷具體如下：

　　(1)屬於典型的“集權式”結構，權力集中於最高管理層，下級缺乏必要的自主權；

　　(2)各職能部門之間的橫向聯絡較差，容易產生脫節和矛盾；

　　(3)直線-職能型組織結構建立在高度的“職權分裂”基礎上，各職能部門與直線部門之間如果目標不統一，則容易產生矛盾。特別是對於需要多部門合作的事項，往往難以確定責任的歸屬；

　　(4)資訊傳遞路線較長，反饋較慢，難以適應環境的迅速變化。

　　直線-職能型組織結構所存在的問題是經常產生權力糾紛，從而導致直線人員和職能參謀人員的摩擦。為了避免這兩類人員的摩擦，管理層應明確他們各自的作用，鼓勵直線人員合理運用職能參謀人員所提供的服務。