可以，但是要有一些注意要點和事項，對於硝化菌的使用千萬不能盲目，否則會帶來嚴重的後果，魚缸中使用硝化菌的幾個大忌

。 忌一.新缸放入硝化菌 剛剛買回來的新魚缸在注入自來水以後，不宜馬上放入硝化菌。因為硝化菌也需要有一定的廢物來做自己的養料，但是在新水中往往是沒有廢物的，硝化菌在沒有養料的情況下就會死亡，汙染水質。

忌二.硝化菌淨水 有些人聽說硝化菌有淨水的效果，就把它當作淨水劑來使用。硝化菌的作用在於分解水中的有毒物質，抑制汙染物的生長，但是並不能除掉水中的雜質，這些需要其他微生物的絮凝作用結成團塊，再由過濾器濾出。

忌三.硝化菌做治療劑 魚兒生病切忌亂投醫，有人用硝化菌當作藥物來治療魚病，這種做法是不對的。上文已經提到，硝化菌可以抑制有害細菌的增加，但並不能直接殺滅病菌，這樣只會造成硝化菌的浪費。

忌四.硝化菌越多越好 一般硝化菌包裝上都會說明每毫升的含量，但是並不代表含量越多越好。因為高濃度硝化細菌很難長時間的進行儲存，硝化細菌在生產運輸銷售的過程中會造成大量的菌體死亡和失效，一般硝化菌的有效期是一年。

忌五.硝化菌不能和鹽配合使用 有人認為硝化菌和鹽不能一起使用，其實這種想法是錯誤的。因為很多硝化細菌都是廣鹽性的，完全可以搭配使用。

忌六.硝化菌作為飼料新增劑 硝化菌蛋白含量高，所以很多人將它作為飼料來使用。其實硝化細菌只能作為水質處理劑來使用，魚兒的飼料中應該新增的最有效生物菌是雙歧桿菌，乳酸桿菌，酵母菌等有益菌群。