明清兩朝的君權高度集中，皇帝擁有至高無上的權利，而朝中的大臣權利相對唐宋時期則要弱很多。比如在唐宋時期，宰相在上朝奏事時可以和皇帝靠得很近或者有座位可以坐。而在明清兩代宰相級別的官員，和皇帝奏事時，只能跪著或者是站著。比如在明朝，有兩個駭人聽聞的做法，那就是廷杖和詔獄，所謂廷杖就是皇上可以在朝廷上，把官員扒開褲子打屁股，這是一種羞辱朝廷大臣的方式，也說明了皇上權力的至高無上。還有一個詔獄，就是皇帝可以不通過當時的司法機構的審判，一直詔令就可以將某個官員打入地牢，執行這一權力的機構有當時的錦衣衛，東廠等，清代尤其是乾隆一朝的文字獄更是達到了登峰造極的地步。

明朝初年，公元1380年。朱元璋借左丞相胡惟庸謀逆一案。撤銷中書省。並嚴令永遠不得設立丞相。清人入關以後，承襲明制，取而代之的在明是內閣制，而清則改為軍機制。從此以後在明清兩朝，君權達到了巔峰。

由於明清兩代的君權缺少相權的制約，最終導致封建君主專制的不可持續和最終的滅亡。

朱元璋在當上皇帝后，為了擁有絕對的權威，決定廢除丞相制度，這成了著名的胡惟庸案的起因， 君權和相權相互制衡的局面被破壞，君權達到頂峰，這直接影響了明清的政治走向。

東廠 錦衣衛 內閣制度的建立，進一步加強了皇權，卻也出現了宦官專權，朋黨傾軋等政風因循的現象。也是致使明朝覆滅的誘因。

八股取士 文字獄，禁錮了人們的思想，抑商政策阻礙了資本主義萌芽，最終使得明清在西方近代文明的衝擊下覆滅。