1、清華大學舞蹈協會

清華大學學生舞蹈協會全稱為“清華大學學生舞蹈愛好者協會”，創立於2004年11月1日，是由清華學生組建的公益性學生社團，旨在發展校園舞蹈文化，豐富同學的課餘生活，為廣大舞蹈愛好者搭建交流學習的平臺。

2、清華大學國學社

清華大學國學社，又名清華大學學生國學社，是一個弘揚中國優秀傳統文化，普及國學知識的學生團體。國學社由清華大學教育研究院研究生李燕紅、魏旗鵬、李德珺，生命科學學院喬盟聯合發起，於2012年12月21日成立。

3、清華大學學生素食文化協會

清華大學學生素食文化協會，是一個以弘揚素食文化、促進大學生健康生活為己任的公益性學生社團，協會成立於2012年6月18日。

4、清華大學學生致知協會

清華大學學生致知協會，是清華大學以學習思考，開拓智慧為中心的一個學生社團，創立於2011年4月24日。

5、清華大學學生綠色協會

清華大學學生綠色協會，成立於1995年4月，是中國最早成立的高校環保組織之一，與此同時，協會的標誌性刊物《綠色希望》創刊。

6、北大腳踏車協會、山鷹社、綠色生命協會、青年馬克思主義發展研究會、書畫社（醫學部）等5家社團獲得“品牌社團”榮譽稱號。

7、愛心社、阿卡貝拉清唱社、中國音樂學社、法律援助協會、學生服務團（醫學部）、學生書畫協會、京昆社、青年天文學會、模擬聯合國協會、醫學視覺化協會（醫學部）獲得“十佳社團”稱號，浦江發展協會、青年智庫學會獲得“新銳社團”稱號。