區域性用藥　　0.1%利福平或0.5%金黴素或四環素眼藥水每日滴眼3～6次，效果較好。但此類藥物水溶後，數週即逐漸失效，需重新配製。若製成眼藥膏或混懸液可儲存較久。10%～30%磺胺醋醯鈉和0.25%～0.5%氯黴素眼藥水易於儲存，效果亦佳。前述各藥一般需持續用藥1～3個月。亦可行間歇療法即用藥3～5日後，停藥2～4周，再行用藥，效果亦佳，易於堅持，對於大部分結瘢而仍有殘餘乳頭增生“小島”者，可以硫酸銅筆腐蝕，促進結瘢。全身治療　　急性期或嚴重的沙眼，除區域性滴用藥物外，成人可口服磺胺製劑等。連續服用7～10天為一療程，停藥1周，可再服用。需2～4個療程，應注意藥物的副作用。手術治療　　乳頭增生嚴重的，可行藥物摩擦，以棉籤或海螵蛸棒蘸蛸棒蘸磺胺或四環素，摩擦瞼結膜及穹隆結膜。濾泡多者行壓榨術，局麻下以輪狀鑷子擠破濾泡，排出其內容，同時合併藥物治療，促進痊癒。對消眼的後遺症如少數倒睫可行電解術，瞼內翻倒睫者，需作手術矯正。

如果是比較輕微的沙眼，在眼睛的區域性滴眼藥水就可以，可以用利福平眼藥水，一些增光眼藥水也可以，白天一天滴三次這樣的眼藥水就可以，如果比較嚴重的話，還可以在晚上用紅黴素軟膏塗在眼睛上，這樣雙管齊下，效果比較好。

有的患者的沙眼內出現了許多的小濾泡，要消除這些小濾泡，可以將眼皮翻過來，進行塗抹或者擠壓，將小濾泡去除就可以，如果在家不方便操作的話，可以去醫院找醫生用擠壓的辦法破壞濾泡，可以減少病毒的存在，一般來說治療兩三次就會有明顯的效果，然後再配上滴眼藥就能夠徹底治癒。