運動性血尿是發生在泌尿系統沒有任何病理改變而完全健康的人身上。其尿血的原因主要是由於運動中腎臟劇烈震動或打擊使之發生創傷，這種創傷可使腎臟血管破裂而出現血尿。如拳擊運動後，大約有28%的人出現血尿，就屬這一種。有些運動專案發生腎創傷的可能性很小，如划船運動，但運動後也會出現血尿，其發生的原因可能是運動時全身的血液分配進行調整，腎臟的血液流量減少，腎小球的濾過率降低，越是劇烈運動，流經腎臟的血液量越少，而大量的血液流向身體活動的部位，如心、肺及肌肉，以便進行劇烈的運動。腎臟血流量減少，腎小球缺血、缺氧而通透性增加。同時，血液中乳酸增加，也使腎小球的通透性增加。另外，運動時腎臟血液迴圈障礙發生淤血，也會使腎小球通透性增加，紅細胞便可透過血管壁進入尿中，出現血尿；長跑運動及長時間直立體位下運動可使腎下垂，腎靜脈迴流受阻，腎瘀血，也可造成血尿。

運動前患有慢性隱匿性泌尿系疾病，如泌尿系統結石、腎小球腎炎、泌尿系統感染等疾病，透過運動使結石滑動刺傷泌尿器官的粘膜而出血；運動加重了原有的炎症及感染程度，造成出血等。這些雖然也是運動後發生血尿，但其主要原因是原來就有病理改變，只是運動誘發出症狀，故血尿還是由原來疾病引起。這種血尿要停止運動，治療原有疾病，等疾病治癒後再參加運動就不會發生血尿了。