區別在於：　　1. 哌拉西林鈉他唑巴坦是青黴素類+酶抑制劑，頭孢哌酮鈉舒巴坦是頭孢類+酶抑制劑 抗菌作用大致相同，抗菌譜頭孢哌酮鈉舒巴坦稍廣，但都可用於G+，G-，厭氧菌感染。　　2.治療具體菌株感染：　　哌拉西林敏感菌：銅綠假單孢菌、大腸埃希菌、變形桿菌、肺炎克雷伯桿菌、淋球菌、不產β-內醯胺酶的沙門菌屬、志賀菌屬、脆弱類桿菌、腸球菌等；不敏感菌：產氣桿菌、枸櫞酸桿菌、普魯威登菌和不動桿菌、沙雷菌屬、產酶流感嗜血桿菌；　　頭孢哌酮是一個第三代頭孢菌素，對β-內醯胺酶的穩定性較差，舒巴坦為廣譜酶抑制劑同時具有較弱的抗菌活性，對金葡菌及多數陰性桿菌產生的β-內醯胺酶具有強大的不可逆的抑制作用，但對某些陰性桿菌染色體介導的β-內醯胺酶無活性。二者聯合，不但對陰性桿菌顯示明顯的協同抗菌活性，聯合後的抗菌作用是單獨頭孢哌酮的4倍。流感桿菌、產氣桿菌、摩根桿菌、類桿菌、大腸桿菌、氟勞地枸櫞酸桿菌、陰溝腸桿菌、不動桿菌、肺炎桿菌等均對本品有較好的敏感性。 主要用於由敏感菌引起的呼吸系統、泌尿生殖系統感染、腹膜炎、膽囊炎、膽道感染、腹腔內感染、敗血症等的治療。　　對於腸桿菌科，兩者一樣；對於銅綠假單胞菌、厭氧、鏈球菌屬，哌拉西林他唑巴坦好些；對於鮑曼不動桿菌，頭孢哌酮舒巴坦好一些。　　3.頭孢哌酮膽汁中濃度較高，可用於膽道感染。另外兩者抗菌譜的區別就在於頭孢三代與抗假單胞青黴素的區別，不良反應方面哌拉西林引起白細胞、血小板降低的機率大些，哌拉西林還可以使真菌檢查GM試驗假陽性。　　在抗菌譜、作用機制上沒有什麼區別。