1.hnRNA，核內不均一RNA。這個RNA就是基因轉錄完的mRNA的前體，包括內含子序列，然後在剪接體的作用下5端加帽，3端加polyA，剪下掉內含子變成成熟的mRNA以後再轉運出核，沒有經過完整加工的hnRNA是不會被轉運出核外的。

2.snRNA，核內小分子RNA，參與mRNA加工，剪接和成熟。

3.snoRNA，核仁小分子RNA，負責rRNA加工（切割和修飾）。

4.端粒酶RNA，是染色體端粒的RNA序列，在具有端粒酶活性的細胞內，它的任務是作為反轉錄的模板然後加在端粒的末端以解決染色體因複製而變短的問題，這種酶在大多數細胞裡是沒有活性的，在某些腫瘤細胞，轉化細胞，幹細胞以及生殖細胞裡活性較高。

5.SRP RNA訊號識別顆粒-RNA：實際上它是和六個多肽結合在一起行使功能的，這個核糖蛋白主要負責終止mRNA的翻譯，同時它還能和內質網（ER）上的停泊蛋白結合使結合了mRNA的定位在內質網上，這個RNA的功能現在俺也不知道，得去看看文獻呵呵。

6tmRNA，這種RNA比較特殊，兼具了mRNA和tRNA的特點。在細胞中參與一種特殊的翻譯反應，即反式翻譯反應。

7.scRNA（細胞質小分子RNA），功能目前不知道。

8.dsRNA，雙鏈RNA，主要在RNAi中起作用。