眾所周知，紅辣椒不只是在料理上的調味品而已，而且它的療效也是為世人所稱道的；長久以來紅辣椒已被用來治療咳嗽、感冒、鼻竇炎和支氣管炎，另有些研究指出可能與預防胃潰瘍或是中風、高血壓、心臟病有關。 紅辣椒是天然的充血解除劑和？痰治咳藥，可消除充血並清除竇炎，這是任何辛辣食品的共同特性。加州大學冉門（Irwin Ziment）教授指出紅辣椒的作用就像我們在藥房裡的感冒藥一樣用來治療呼吸道的疾病，紅辣椒之所以如此神奇的清除鼻塞其中含有讓舌頭有辣味感覺的植物性化學物質－番辣椒素。 冉門教授指出食用紅辣椒比服用感冒藥所感受的衝擊來得大，主要是當紅辣椒接觸到舌頭時，大腦接受來自嘴巴舌頭傳來強烈的訊息，因此刺激呼吸道產生分泌的內分泌線來回應訊息，結果會使分泌物洶湧而至使眼睛充滿淚水、流鼻水、並解除肺部中的黏液。 在飲食中攝取愈多紅辣椒愈能強化個人對抗老化的能力因為它們是抗氧化劑維他命C和Beta胡蘿蔔素的禮富來源。這些抗氧化劑能藉著中和自由基（一種在體內自然堆積並造成細胞損壞的有害分子）來保護身體。研究人員指出攝取更多的抗氧化維他命，可預防導致癌症、心臟病、中風、關節炎等類疾病。

飯量減少時，在菜裡放上一些辣椒，就能改善食慾，增加飯量。單獨用少許辣椒煎湯內服，可治因受寒引起的胃口不好、腹脹腹痛。過多的辣椒素會劇烈刺激胃腸粘膜，使其高度充血，促使痔瘡出血。