樹化玉首先是木化石，再者是玉。樹化玉同時具備了化石與玉石的特性，既有矽化木的纖維構造，又有玉石般晶瑩剔透的華麗外表。樹化玉是化石與玉石的完美統一體，這一點也正是樹化玉價值節節攀升的最主要因素。同時樹化玉也是高硬度的，摩氏硬度7.1—7.3之間，與硬玉翡翠不相上下。相信如果有一天，樹化玉如同翡翠一樣為眾人接受時，我們肯定也得把它歸類為硬玉，那時候翡翠便多了個兄弟。

樹化玉不同於普通矽化木，它具有透明度。但是樹化玉的“透”，具有木化石的特性。樹化玉的“透”不是水晶般的透，可以一眼看到底。樹化玉的透是可以看得進去很深，但總也望不穿，讓人慾罷不能（這一點與翡翠有點相似）。

樹化玉因為是木化石，所以肯定保留了原始的木紋構造。就算是質地最為一流玉化的樹化玉，我們依然可以在純玉化的樹化玉內找到纖維狀構造的殘餘，或多或少，一絲一絲。如同原始的木紋一樣縱向分佈，也就是說樹化玉的構造類似於纖維狀的聚合體。也正是這一點的震懾，樹化玉的作假僅僅限於樹化玉色澤的改進上，而不存在純粹的人工造假樹化玉。因為原始生命遺留下來的的木紋結構，是現代工藝所無法模擬的。

樹化玉顏色多變，色彩斑斕。跟其他的玉石類似，樹化玉的色澤也是自內而外表現出來，如同刷漆一樣漂浮在表面的綠色、雞血紅色就會格外讓人注意。因為目前市面已經出現了顏色造假的樹化玉，主要存在於綠色和雞血紅色這兩種。三大頂級樹化玉色種，只有墨色樹化玉因其特殊的生物成因得以倖免。