1、投資範圍不同。這是債券基金與貨幣基金最大的區別。債券基金，是指主要投資於債券的基金。貨幣基金，即貨幣市場基金，是指投資於貨幣市場工具的基金。

具體看來，債券基金的投資物件是主要是各類債券，包括企業債，政府債，公司債、可轉債等等。一般來，80%以上的基金資產投資於債券的，就叫“債券基金”。如果基金100%投資於債券，那麼又叫“純債基金”。

貨幣基金只能投資於貨幣市場工具。貨幣市場工具主要是指到期日不足1年的短期工具，包括大額存單、央行票據，債券回購等等。貨幣基金也可以投資於債券，但對於債券的要求較高，一般是剩餘期限在397天以內的債券，投資企業債，則要求信用等級在AAA以上。

貨幣基金不能投資於股票、可轉債以及信用評級低的債券等高風險產品。

2、適用人群不同。債券的風險較低，因此債券基金一般也被認為是收益和風險都適中的投資工具。貨幣基金的風險更低，而且流動性好，但是長期收益率低。最常見的貨幣基金就是餘額寶，目前收益率在4%左右。只能作為暫時存放資金的場所，長期收益率低，不適合進行長期投資。

3、申購與贖回

在申購時間和費率上，二者也有很大不同。貨幣基金的認購費率為0，但是貨幣基金會從基金費用中提取不高於0.25%的服務管理費用。另外，貨幣基金的基金淨值固定在1.00元/份，超出1元的部分會分紅，且每日分配收益。

債券型基金債券型基金的認購費用一般在1%以下，單位淨值每天都有變化。