非轉基因大豆油一級和三級的區別有：

差別在脫色和脫嗅上。一級油就是老的色拉油，顏色淺，煙點高，沒有味道，適用於煎炒烹炸；三級油是老國標一級油，少了脫色和脫嗅工藝，減少了白土汙染的可能和維生素E的損失，顏色深，煙點低，有大豆的味道（喜歡的人說是豆香味，不喜歡的人說是豆腥味），適用於東北的燉菜。他們之間沒有好壞之分，凡是有一利必有一弊。一級大豆油雜質少了、純淨了，同時營養成分也少了。而三級油雖然有一些所謂雜質，但是更多保留了營養成分。一級油適合涼拌，因沒有豆腥味兒，油炸不容易“上色”，具有特殊感觀。三級油保留了一些豆油特有的氣味，俗稱“香味兒”，適合油炸、炒菜。兩種都有各有千秋。

轉基因大豆指的是將某些物種所呈現出優秀性狀的基因，轉入可滿足人類生存需求的動、植物、微生物基因組中， 以使物種表現出其自身缺乏的優秀性狀。 在基因轉入過程中，由於不可預見的基因突變，可能會轉化為會對人體產生危害的有毒蛋白質等諸多因素。所以涉及到轉基因的安全問題 。世界糧農組織、世界衛生組織及經濟合作組織表示轉基因食品可能帶來環境風險和健康風險，人工移植外來基因可能令生物產生 " 非預期後果 "。