原核細胞中的DNA主要存在於擬核中，擬核實際上是一個大型環狀的DNA分子，如對原核細胞用染色劑染色，綠色集中的部位就是擬核。原核生物基因分為編碼區與非編碼區。所謂的編碼區就是能轉錄為相應的信使RNA，進而指導蛋白質的合成，也就是說能夠編碼蛋白質。非編碼區則相反，但是非編碼區對遺傳資訊的表達是必不可少的，因為在非編碼區上有調控遺傳資訊表達的核苷酸序列。非編碼區位於編碼區的上游及下游。在調控遺傳資訊表達的核苷酸序列中最重要的是位於編碼區上游的RNA聚合酶結合位點。RNA聚合酶是催化DNA轉錄為RNA，能識別調控序列中的結合位點，並與其結合。擴充套件資料原核生物包括真細菌和古生菌兩大類群，但由於古生菌又具有許多真核生物的特徵，明顯區別於細菌，因此不將古生菌列入其中。具體根據外表特徵等方面可以把原核生物分為狹義的細菌、藍細菌、放線菌、支原體、衣原體、螺旋體和立克次氏體七大類。與真核生物的種類相比，已發現的原核生物種類雖不甚多，但其生態分佈卻極其廣泛，生理效能也極其龐雜。有的種類能在飽和的鹽溶液中生活；有的卻能在蒸餾水中生存；有的能在0℃下繁殖；有的卻以70℃為最適溫度。有的是完全的無機化能營養菌，以二氧化碳為唯一碳源；有的卻只能在活細胞內生存。在進行光合作用的原核生物中，有的放氧，有的不放氧；有的能在pH為10 以上的環境中生存，有的只能在pH為1左右的環境中生活。