1)翻譯-運轉同步機制：當新生肽鏈合成約70個氨基酸時，SRP與訊號肽和遊離核糖體結合，此時多肽合成暫時終止。SRP-訊號肽-核糖體複合物被引向內質網膜並與SRP的受體結合，此時多肽合成恢復，訊號肽部分透過膜上的核糖體受體和蛋白質轉運複合物跨膜進入內質網內腔，新生肽鏈重新開始延伸。整個蛋白跨膜後，訊號肽被水解，形成高階結構和成熟蛋白質，並被運送到相應細胞器。
2)翻譯後轉運機制
A.線粒體蛋白質跨膜運轉：還有前導肽的蛋白質，首先由外膜上的Tom受體複合物蛋白識別與Hsp70或MSF等分子伴侶，透過Tom和Tim組成的莫通道進入線粒體內腔。同時需要ATP水解的能量。
B.葉綠體蛋白質的跨膜轉運：葉綠體蛋白前體與膜上特定位點結合後進入葉綠體基質，此時可溶性蛋白水解酶切除第一部分跨膜訊號肽，如果此多肽還含有進入內囊體的訊號肽，那麼它可以繼續進入內囊體。
C.核定位蛋白的轉運機制：α和β組成的異源二聚體是核定位蛋白的可溶性受體，其與核定位蛋白結合後，停靠在核孔處，依靠Ran GTP酶水解GTP提供能量進入細胞核，α和β亞基解離，核蛋白與α亞基解離，α和β分別透過核孔複合體回到細胞質基質中，起始新一輪蛋白質運轉。
D.細菌中蛋白質的跨膜轉運：細菌中新翻譯產生的蛋白質與胞質中的分子伴侶SecB 相結合後就能被轉運到細胞膜運轉複合物SecA-SecYEG上，結合有新生肽的SecA在自身ATP酶活性作用下水解ATP並嵌入細胞膜中，導致與SecA相結合的被轉運蛋白N端約20個氨基酸透過膜轉運複合物到達胞外。SecA再與另一個ATP相結合，變構嵌入膜內的同時再次把所運轉蛋白的第二部分運出胞外，如此反覆，直到把所運轉蛋白全部運送出去。
1)翻譯-運轉同步機制：當新生肽鏈合成約70個氨基酸時，SRP與訊號肽和遊離核糖體結合，此時多肽合成暫時終止。SRP-訊號肽-核糖體複合物被引向內質網膜並與SRP的受體結合，此時多肽合成恢復，訊號肽部分透過膜上的核糖體受體和蛋白質轉運複合物跨膜進入內質網內腔，新生肽鏈重新開始延伸。整個蛋白跨膜後，訊號肽被水解，形成高階結構和成熟蛋白質，並被運送到相應細胞器。
2)翻譯後轉運機制
A.線粒體蛋白質跨膜運轉：還有前導肽的蛋白質，首先由外膜上的Tom受體複合物蛋白識別與Hsp70或MSF等分子伴侶，透過Tom和Tim組成的莫通道進入線粒體內腔。同時需要ATP水解的能量。
B.葉綠體蛋白質的跨膜轉運：葉綠體蛋白前體與膜上特定位點結合後進入葉綠體基質，此時可溶性蛋白水解酶切除第一部分跨膜訊號肽，如果此多肽還含有進入內囊體的訊號肽，那麼它可以繼續進入內囊體。
C.核定位蛋白的轉運機制：α和β組成的異源二聚體是核定位蛋白的可溶性受體，其與核定位蛋白結合後，停靠在核孔處，依靠Ran GTP酶水解GTP提供能量進入細胞核，α和β亞基解離，核蛋白與α亞基解離，α和β分別透過核孔複合體回到細胞質基質中，起始新一輪蛋白質運轉。
D.細菌中蛋白質的跨膜轉運：細菌中新翻譯產生的蛋白質與胞質中的分子伴侶SecB 相結合後就能被轉運到細胞膜運轉複合物SecA-SecYEG上，結合有新生肽的SecA在自身ATP酶活性作用下水解ATP並嵌入細胞膜中，導致與SecA相結合的被轉運蛋白N端約20個氨基酸透過膜轉運複合物到達胞外。SecA再與另一個ATP相結合，變構嵌入膜內的同時再次把所運轉蛋白的第二部分運出胞外，如此反覆，直到把所運轉蛋白全部運送出去。