1、自主智慧財產權問題

2、對企業研究開發組織管理水平、科技成果轉化能力、自主智慧財產權數量、銷售與總資產成長性如何進行評價

3、如何判定企業能否申報高新技術企業？

　　有沒有研發，研發的投入和盈利。

　　有沒有智慧財產權，智慧財產權的數量，以及與你研發的專案的匹配程度。

　　有沒有研發人員，研發人員的學歷，以及每個專案參與的研發人員。

　　公司有沒有指定研發制度，獎勵制度，平時專案探討的時候有沒有做好記錄。

　　有沒有進行產學研；公司的銷售和盈利情況。

　　1.缺少自主智慧財產權。核心自主智慧財產權是申請高新技術企業的必備要件之一，如果企業沒有智慧財產權或僅有商標權，將難以透過新高新技術企業認定。一些企業往往以購買的或者所謂“產學研”合作方式取得的驗新報告充作自主智慧財產權。

　　2.虛報研發費用，一些企業管理鬆散，未對研發費用進行單獨核算，造成目前研發費用不足。也有一些企業透過外地的所謂研究學院，虛假開具發票，即套出資金，偷逃個人所得稅，又能達到高新技術企業研發費用使用的要求，還能所得稅前加計扣除。

　　3.科技和研發人員比例達不到規定指標。規模較大的生產企業，由於生產技術工人較多，科技人員和研發人員的比例無法達到30%和10%的最低要求，建議企業透過勞務外包或分立生產環節提高科技和研發人員的比例。

　　4.高新技術產品銷售達不到認定要求，申報資料失實。一些企業在取得某項產品的“高新產品認證”後，因產品成本、市場等因素未能大規模銷售，讓其他產品以該新產品名義開具發票作銷售，虛增高新技術新產品銷售金額。也有的企業，用取得的高新技術新新產品零配件，生產到其產品中，以產品銷售混做高新產品的銷售。