消毒種類分疫源地消毒和預防性消毒兩種，也可按照消毒水平的高低，分為高水平消毒、中水平消毒與低水平消毒。

疫源地消毒

是指有傳染源（病者或病原攜帶者）存在的地區，進行消毒，以免病原體外傳。疫源地消毒又分為隨時消毒和終末消毒二種。隨時消毒是指及時殺滅並消除由汙染源排出的病原微生物而進行的隨時的消毒工作。

消毒車間

終末消毒是指傳染源住院隔離，痊癒或死亡後，對其原居地點進行的徹底消毒，以期將傳染病所遺留的病原微生物徹底消滅。在醫院中傳染源停止隔離出院後，對物品及病房的消毒亦為終末消毒。

預防性消毒

是指未發現傳染源情況下，對可能被病原體汙染的物品、場所和人體進行消毒措施。如公共場所消毒，運輸工具消毒，飲水及餐具消毒，飯前便後洗手均屬之。醫院中手術室消毒，免疫受損嚴重的病人，如骨髓移植病人預防性隔離及消毒措施亦為預防性消毒。

Sunny消毒

高水平消毒

殺滅一切細菌繁殖體包括分枝桿菌、病毒、真菌及其孢子和絕大多數細菌芽孢。達到高水平消毒常用的方法包括採用含氯製劑、二氧化氯、鄰苯二甲醛、過氧乙酸、過氧化氫、臭氧、碘酊等以及能達到滅菌效果的化學消毒劑在規定的條件下，以合適的濃度和有效的作用時間進行消毒的方法。

中水平消毒

殺滅除細菌芽孢以外的各種病原微生物包括分枝桿菌。達到中水平消毒常用的方法包括採用碘類消毒劑（碘伏、氯己定碘等）、醇類和氯己定碘的複方、醇類和季銨鹽類化合物的複方、酚類等消毒劑，在規定條件下，以合適的濃度和有效的作用時間進行消毒的方法。

低水平消毒

能殺滅細菌繁殖體（分枝桿菌除外）和親脂類病毒的化學消毒方法以及通風換氣、沖洗等機械除菌法。如採用季銨鹽類消毒劑（苯扎溴銨等）、雙胍類消毒劑（氯己定）等，在規定的條件下，以合適的濃度和有效的作用時間進行消毒的方法。