複方魚腥草合劑，用於外感風熱引起的咽喉疼痛；急性咽炎、扁桃腺炎有風熱證候者。雙黃連口服液，疏風解表，清熱解毒，用於外感風熱所致的感冒，症見發熱、咳嗽、咽痛。二者同屬主治外感風熱症的藥物，但重點不同，複方魚腥草合劑主要針對咽喉炎、扁桃腺炎症狀，雙黃連口服液則針對有感冒症狀，比如流涕、打噴嚏等，並伴有咽痛的輕微症狀。

魚腥草合劑主要配方含有魚腥草、黃芩、板蘭根、連翹、金銀花；雙黃連口服液主要配方含有黃芩、金銀花、連翹。二者相比魚腥草合劑配方多了魚腥草和板藍根兩味藥物，其一魚腥草，味辛，性寒涼，歸肺經，主要作用有抗菌、抗病毒、增強免疫功能的作用，其二板藍根性苦寒，具有清熱解毒，涼血利咽之功效。

二者同屬治療外感風熱症的常用中成藥，不可聯合服用，避免用量過大，產生不良毒副作用。在症狀初期，服用雙黃連口服液效果不明顯，並符合魚腥草合劑相關症狀的，可以改用魚腥草合劑，前提對該藥物無過敏反應。咽喉及扁桃體炎症明顯並伴隨發熱者，應在醫生的指導下進行抗感染治療。

魚腥草合劑和雙黃連口服液同屬治療外感風熱症的常用中成藥，風寒症狀者並不適用，切忌亂用藥物。風寒表現為發熱輕、無汗、頭痛身痛、鼻塞流清涕、咳嗽吐稀白痰、口不渴或渴喜熱飲；風熱表現為發熱重、頭脹痛、有汗、咽喉紅腫疼痛、咳嗽、痰粘或黃、鼻塞黃涕、口渴喜飲、舌尖邊紅。注意區分二者症候。

藥物的應用應嚴格按照藥品說明書及醫囑進行，禁止擅自變換藥物種類及用藥時間、用藥量等。