植物病害的生物防治主要包括：

（1）抗生菌的利用。即利用產抗生素的微生物來防治土傳真菌病害。隨著研究的深入，一些可以參與營養物質的爭奪、侵染點的佔領、誘導植物產生免疫力，乃至直接對病原物襲擊等微生物均作為生防資源來進行發掘。

（2）重寄生物的利用。植物病原微生物大多是寄生物，在它們生活的某些階段也經常被另一些微生物寄生，從而失去侵染致病能力甚至被置於死地。重寄生物有多種型別，主要有重寄生真菌，如腐黴等根腐病原可被一些叢梗孢目真菌所寄生，以致菌絲、孢子囊和卵孢子等器官被破壞；寄生真菌的病毒，如從患病的蘑菇上可提純到病毒。

（3）抑制性土壤的利用。抑制性土壤又稱抑病土、抑菌土等，其主要特點是，病原物引入後不能存活或繁殖；病原物可以存活並侵染，但感病寄主受害很輕微；病原物在這種土中可以引起嚴重病害，但經過幾年或幾十年發病高峰之後，病害減輕至微不足道的程度。

（4）根際微生物和菌根的作用。植物根的滲出物主要有糖類、氨基酸類、脂肪酸、生長素、核酸和黴類等，聚集在根的四周富整合豐富的營養帶，刺激了細菌等微生物的大量繁殖，這種效應叫根際效應。由根滲出物的影響，其中包括營養物質的礦質化，共生及非共生固氮，形成菌根，並影響病原微生物及其他微生物的活動等。