鹿的大體形態結構特點與其它反芻動物如牛、羊基本相似。

鹿有腰椎6個，其錐體稍長；有5個已經癒合的椎骨形成的薦骨；7—9個尾椎。前肢骨自上而下為肩胛骨、肱骨、尺骨與橈骨、腕骨、掌骨和指骨。後肢骨自上方為骨盆。從髖關節起連線股骨、脛腓骨、髕骨、跗骨、蹠骨與趾骨。

鹿的頭部特徵是額部較廣，顏面部變狹。頸一般細長，有7個頸椎。胸部比較寬廣。有13個胸椎，每一胸椎左右各有一根肋骨，即共有肋骨13對。胸骨兩側有7對肋窩與真肋相接。劍狀軟骨較為發達。

鹿有鼻鏡，中含鼻唇腺，能分泌汗液，鼻孔較小，鼻翼活動性較差。氣管長，有49—55個軟骨環。左、右肺各有3個肺葉，另有一中間葉。心臟在兩肺之間偏左。呈圓錐形。

鹿的肌肉發達，尤以胸和四肢上部。鹿肌肉為紅肌肉，肌細胞內富含肌紅蛋白。四肢下方筋腱粗長。

鹿有瘤胃、網胃、瓣膜和皺胃共4個胃。中以瘤胃的容積最大，幾乎佔據左腹的大部分。腸管分十二指腸、空腸、迴腸、盲腸、結腸與直腸，前接皺胃，後達肛門。十二指腸附近有胰腺組織。

鹿肝在膈後正中偏右，分左、中、右、尾四個肝葉。無膽囊。脾近似橢圓形，表面呈藍青色，切面為紅褐色。位於腹部左側。腎左右各一，如蠶豆狀，紅褐色。表面光滑無溝，切面見呈多乳頭結構。