1 神經遞質的胞吐是作為訊號傳遞的一種方式，例如A細胞分泌γ-氨基丁酸抑制B細胞。 而跨膜運輸是物質的運輸方式，比如A細胞透過離子通道吸收10000個鈉離子。二者有較大差別，並不能放在一起作為對比。2 而神經遞質透過胞吐分泌的原因為：2.1 想想細胞對於遞質來說是巨大無比的啊，遞質飄來飄去是很難到達突觸前的，哪怕偶爾幾個飄到了也是沒有太大的影響力。於是遞質需要在囊泡濃縮及運輸（這個運輸很好玩的，像馬車跑在公路上…），以保證遞質能到達突觸前膜和保證有足以影響鄰近細胞的濃度。2.2 囊泡的釋放受鈣離子內流事件操控，於是神經電訊號-離子事件-囊泡釋放串聯起來，做到遞質這個化學訊號能夠準確傳遞（不然剛生產出來的遞質馬上就釋放，臉都抽成癱了就麻煩了）。2.3 遞質需要囊泡保護起來，以免胞內被回收。（當然，胞外也有回收，但是這是胞外酶作為終止訊號及回收物質再投入生產。）2.4 囊泡充當了部分神經遞質的合成場所功能，例如去甲腎上腺素就是在囊泡內合成。等等理由（近年研究發現也有非囊泡形式釋放遞質的，它本身是不依賴鈣離子的，而是透過某種特殊蛋白的活動XD..（噴出去嗎？啊哈哈哈哈），題主你是不是想問這個方式和囊泡方式的優劣對比…那，你研究去吧，好了告訴大家答案。）3 如果單純問胞吐與跨膜運輸那就有比較大的可比性。因為就膜轉運這個大類來說，主要為跨膜運輸（被動運輸，主動運輸）、非跨膜運輸（胞吞胞吐）。