內在因素

1、數量稀少，難以大量繁殖。

2、繁殖率低，生長較慢。

人為因素

1、人類對其食物魚蝦進行過度捕撈，致使白鱀豚得不到充足的食物供給。

2、人類對長江的過度開發，使白鱀豚的棲息地遭到嚴重干擾和破壞。

3、人類在長江附近建造的化工廠和醫藥廠，使長江水質受到嚴重汙染。

4、長江成為了非常繁忙的運輸水道，很多白鱀豚被船隻的螺旋槳打死打傷。

由於人類活動增加或活動不當，使白鱀豚意外死亡事故增多。據統計，1973—1985年間，共意外死亡59頭，其中被魚用滾鉤或其它漁具致死29頭，佔48.8%。

被江中爆破作業致死11頭，佔18.6%；被輪船螺旋槳擊斃12頭，佔20%；擱淺死亡6頭，佔10%；誤進水閘1頭，佔1.6%。另據統計，長江下游水域中意外死亡的白鱀豚，有三分之一是被輪船螺旋槳擊斃的。

擴充套件資料：

分佈範圍

從三峽地區的宜昌葛洲壩上游35千米處，一直到上海附近的長江入海口，包括洞庭湖和鄱陽湖在內，全長約1700千米的江水中都有白鱀豚的分佈。但是長期以來受到人類活動的影響，其種群數量和分佈區域逐漸縮小。後來僅侷限於長江中下游及與其連通的洞庭湖、鄱陽湖、錢塘江等水域中，尤以荊州市沙市區以下的湖北、湖南、安徽、江蘇的江段為多。

到1990年代，白鱀豚在洞庭湖與鄱陽湖已經絕跡。在長江中分佈範圍的上限也已移至葛洲壩下游170千米處的荊州附近。其下限縮減更為嚴重，到南京附近就已蹤跡罕至。在1997年至1999年的觀測中，在南京下游臨近的江陰以下就再未有發現。

2000年至2004年的幾次觀測中，其分佈主要限於長江銅陵段、九江段和洪湖段三個區域。最後一次得到證實在野外發現白鱀豚，是2004年8月在長江南京段發現的一頭擱淺死去的屍體。

2006年11月6日—12月13日，近40名科學家對宜昌到上海長江中下游的幹流1700千米江段進行地毯式搜尋，未發現一頭白鱀豚，因此不少科學家懷疑白鱀豚已經滅絕。但可以推斷，長江中下游還有少量殘存，然而僅憑這最後幾隻個體，已經難以延續種群。