最大的影響是不利於原領事館所在地的本國公民辦理簽證業務，也不利於領事館所在國公民申請簽證。

一般情況下，設有領事館的城市都是人口密集，經濟發達的地區，關閉領事館會影響兩國兩地居民的相互來往和貿易溝通，增加辦理簽證的成本。

關閉領事館是兩國關係惡化在外交上的體現這是一種常見的外交方式，影響遠不及關閉大使館嚴重。

主要兩個方面的影響。

一個是表面上的影響。比如說影響到該領事館所覆蓋地區的功能服務，眾所周知，領事館的存在是為了分擔大使館的日常工作壓力，同時也是為了方便僑民設立的，最典型的就是，僑居該國公民的簽證，護照換髮這類工作。除此之外還有，該國企業在海外市場的支援等等。隨著領事館的取消，該地區的這些需求就會被轉移到其他地方的領事館，大大增加了當地僑民的通勤時間空間成本。

其次是外交方面的影響。標誌著兩國關係惡化，雙方關閉領事館是雙方的一種對抗手段，同時也傷害可控，而不是一味的去攻擊。

至於內在的影響，毋庸置疑，那就是在政治，外交，情報方面的影響了。根據國際慣例，即《維也納公約》等國際條約，任何國家的外交使領館都是該國的領土主權範圍，是不允許其他國家的公職人員進入的，可謂是法外之地，因此就有很多見不光的交易了，比如說：該地區的政治，經濟，軍事等各個情報的蒐集與分析，對友好團體的支援與幫助（培養代理人），最典型的莫過於使館武官一職，該職務往往由高階軍官擔任，除了協調兩國在軍事方面的合作與交流外，更為重要的是對所在地區的軍事領域的動態監視和情報蒐集二戰期間的日本太平洋艦隊總司令山本五十六就曾經擔任過日本駐美大使館的武官一職，對美進行深入研究，算是日本軍方高層的美國通，深入考察了美國的鋼鐵，石油，機械等行業，對其強大的戰爭潛力是有深刻的認識，因此也是極力阻止對美開戰，即使先發制人，透過偷襲也只能取得半年到一年左右的軍事優勢。後面的歷史也證明了山本五十六的判斷，從珍珠港事件開始到中途島海戰，也就一年多的時間。

而隨著領事館的關閉，就等於失去了一雙眼睛，無法繼續獲得來自所在地區的各類戰略情報，繼而導致其高層產生錯誤決策，影響其在該地區的國家利益。