分類方法有很多種，依據也各不相同，對生物來說比較重要的是生物體自身能否合成，這個在第4點。
1.根據氨基酸分子中所含氨基和羧基數目的不同，將氨基酸分為中性氨基酸、酸性氨基酸和鹼性氨基酸：
中性氨基酸有甘氨酸、丙氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸、胱氨酸、半胱氨酸、甲硫氨酸、蘇氨酸、絲氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、脯氨酸、蛋氨酸和羥脯氨酸，這類氨基酸分子中只含有一個氨基和一個羧基
酸性氨基酸有穀氨酸、天門冬氨酸，這類氨基酸分子中含有一個氨基和二個羧基
鹼性氨基酸有賴氨酸、精氨酸、組氨酸，這類氨基酸的分子中含二氨基一羧基；組氨酸具氮環，呈弱鹼性，也屬鹼性氨基酸。
2.根據氨基酸的極性分類：
非極性氨基酸有甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸
極性氨基酸有色氨酸、酪氨酸、絲氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬醯胺、谷氨醯胺、蘇氨酸、天冬氨酸、穀氨酸、賴氨酸、精氨酸、組氨酸
其中，屬於芳香族氨基酸的是：色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸
屬於亞氨基酸的是：脯氨酸
含硫氨基酸包括：半胱氨酸、蛋氨酸
3.按其親水性、疏水性可分為：
親水性氨基酸：D, E, H, K, Q, R, S, T, 羥脯氨酸, 焦穀氨酸
疏水性氨基酸：A, F, I, L, M, P, V, W, Y, α-氨基丁酸, β-氨基丙氨酸, 正亮氨酸
未定類：C和G
4.根據生物體能否自身合成：
必需氨基酸：指人體（或其它脊椎動物）不能合成或合成速度遠不適應機體的需要，必需由食物蛋白供給，這些氨基酸稱為必需氨基酸。共有10種其作用分別是賴氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、蘇氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、纈氨酸、精氨酸、組氨酸；人體雖能夠合成Arg和His，但合成的量通常不能滿足正常的需要，因此，這兩種氨基酸又被稱為半必需氨基酸。
非必需氨基酸：指人（或其它脊椎動物）自己能由簡單的前體合成，不需要從食物中獲得的氨基酸。例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。
分類方法有很多種，依據也各不相同，對生物來說比較重要的是生物體自身能否合成，這個在第4點。
1.根據氨基酸分子中所含氨基和羧基數目的不同，將氨基酸分為中性氨基酸、酸性氨基酸和鹼性氨基酸：
中性氨基酸有甘氨酸、丙氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸、胱氨酸、半胱氨酸、甲硫氨酸、蘇氨酸、絲氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸、脯氨酸、蛋氨酸和羥脯氨酸，這類氨基酸分子中只含有一個氨基和一個羧基
酸性氨基酸有穀氨酸、天門冬氨酸，這類氨基酸分子中含有一個氨基和二個羧基
鹼性氨基酸有賴氨酸、精氨酸、組氨酸，這類氨基酸的分子中含二氨基一羧基；組氨酸具氮環，呈弱鹼性，也屬鹼性氨基酸。
2.根據氨基酸的極性分類：
非極性氨基酸有甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸
極性氨基酸有色氨酸、酪氨酸、絲氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬醯胺、谷氨醯胺、蘇氨酸、天冬氨酸、穀氨酸、賴氨酸、精氨酸、組氨酸
其中，屬於芳香族氨基酸的是：色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸
屬於亞氨基酸的是：脯氨酸
含硫氨基酸包括：半胱氨酸、蛋氨酸
3.按其親水性、疏水性可分為：
親水性氨基酸：D, E, H, K, Q, R, S, T, 羥脯氨酸, 焦穀氨酸
疏水性氨基酸：A, F, I, L, M, P, V, W, Y, α-氨基丁酸, β-氨基丙氨酸, 正亮氨酸
未定類：C和G
4.根據生物體能否自身合成：
必需氨基酸：指人體（或其它脊椎動物）不能合成或合成速度遠不適應機體的需要，必需由食物蛋白供給，這些氨基酸稱為必需氨基酸。共有10種其作用分別是賴氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、蘇氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、纈氨酸、精氨酸、組氨酸；人體雖能夠合成Arg和His，但合成的量通常不能滿足正常的需要，因此，這兩種氨基酸又被稱為半必需氨基酸。
非必需氨基酸：指人（或其它脊椎動物）自己能由簡單的前體合成，不需要從食物中獲得的氨基酸。例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。