因為用亞甲基藍溶液染色後,被染為深藍色的部分是（細胞核）亞甲基藍可以結合核酸,使細胞核呈藍色，臺盼藍能使死細胞著色。
亞甲基藍（化學式：C₁₆H₁₈ClN₃S，分子量：319.86），3,7-雙（二甲氨基）吩噻嗪-5-鎓氯化物，是一種吩噻嗪鹽，正電荷不穩定。外觀為深綠色青銅光澤結晶（三水合物），熔點215ºC，閃點14℃，密度1g/mL。可溶於水/乙醇，不溶於醚類。亞甲基藍在空氣中較穩定，其水溶液呈鹼性，有毒。亞甲基藍廣泛應用於化學指示劑、染料、生物染色劑和藥物等方面。
在工業次甲基藍（鹼性湖藍BB）10kg中加入100kg純水，邊攪拌邊通蒸汽加熱至80～90℃，使之溶解。然後用30min時間緩慢加入20%的碳酸鈉熱溶液7.5kg，繼續攪拌10min，靜置半小時後，將溶液加熱，溫度不超過90℃，趁熱過濾，在清亮濾液中加入3kg1∶1的鹽酸，攪拌均勻後，冷卻結晶，結晶完全後，離心甩幹，於40～50℃乾燥，即得成品。
亞甲藍還具有氧化性，可以氧化一些還原性較強的物質，例如葡萄糖或鋅，自身被還原成無色的還原態亞甲藍（有人稱亞甲基白）。在被還原後，還原態的亞甲藍便具有一定的還原性，可以被一些氧化性物質，如空氣中的氧氧化，又生成氧化態的藍色亞甲藍。因此亞甲藍可用於氧化-還原滴定，也可用來示範氧化-還原振盪反應。
因為用亞甲基藍溶液染色後,被染為深藍色的部分是（細胞核）亞甲基藍可以結合核酸,使細胞核呈藍色，臺盼藍能使死細胞著色。
亞甲基藍（化學式：C₁₆H₁₈ClN₃S，分子量：319.86），3,7-雙（二甲氨基）吩噻嗪-5-鎓氯化物，是一種吩噻嗪鹽，正電荷不穩定。外觀為深綠色青銅光澤結晶（三水合物），熔點215ºC，閃點14℃，密度1g/mL。可溶於水/乙醇，不溶於醚類。亞甲基藍在空氣中較穩定，其水溶液呈鹼性，有毒。亞甲基藍廣泛應用於化學指示劑、染料、生物染色劑和藥物等方面。
在工業次甲基藍（鹼性湖藍BB）10kg中加入100kg純水，邊攪拌邊通蒸汽加熱至80～90℃，使之溶解。然後用30min時間緩慢加入20%的碳酸鈉熱溶液7.5kg，繼續攪拌10min，靜置半小時後，將溶液加熱，溫度不超過90℃，趁熱過濾，在清亮濾液中加入3kg1∶1的鹽酸，攪拌均勻後，冷卻結晶，結晶完全後，離心甩幹，於40～50℃乾燥，即得成品。
亞甲藍還具有氧化性，可以氧化一些還原性較強的物質，例如葡萄糖或鋅，自身被還原成無色的還原態亞甲藍（有人稱亞甲基白）。在被還原後，還原態的亞甲藍便具有一定的還原性，可以被一些氧化性物質，如空氣中的氧氧化，又生成氧化態的藍色亞甲藍。因此亞甲藍可用於氧化-還原滴定，也可用來示範氧化-還原振盪反應。