由於胚胎幹細胞可以在實驗室內無限制的長期培養，帶來了移植後可能會在人體內形成腫瘤的顧慮，事實上，用來證明人類胚胎幹細胞具有多能性的最好評鑑方法，就是把人類胚胎幹細胞注射進入小鼠的肌肉層組織，若這些細胞可以產生良性腫瘤（Teratoma），才能真正的證明它們是具多能性的胚胎幹細胞。而且臨床前研究資料已顯示,把人類胚胎幹細胞直接注射到已經移植在小鼠身上的數種不同的人的組織,包括肝、肺和小腸,都會形成惡性腫瘤。所以未來臨床上的應用，會朝向先把人類胚胎幹細胞在實驗室引導分化成為某種特定功能細胞，然後再把這些特定功能細胞純化出來做為移植用,而目前這方面的研究進展非常的緩慢。

成體幹細胞是指存在於一種已經分化組織器官中的未分化細胞，這種細胞能夠自我更新並且能夠分化形成組成該特定組織器官的各種功能細胞。成年動物的許多組織和器官，比如表皮和造血系統，具有修復和再生的能力。成體幹細胞在其中起著關鍵的作用。在特定條件下，成體幹細胞或者產生新的幹細胞，或者按一定的程式分化，形成新的功能細胞，從而使組織和器官保持生長和衰退的動態平衡。過去認為成體幹細胞主要包括上皮幹細胞和造血幹細胞。最近研究表明，以往認為不能再生的器官組織像是腦和心臟仍然存在有各自的幹細胞，像是神經幹細胞和心臟幹細胞，說明不同的成體幹細胞普遍存在於各個不同的器官組織中。成體幹細胞經常位於特定的微環境中。微環境中的間質細胞能夠產生一系列生長因子或配體，與幹細胞相互作用，控制幹細胞的更新和分化。研究人員認為，幹細胞存在於組織的特定區域內，從而在數年內都維持靜止休眠狀態-也就是保持不分裂的狀態，直到組織受到損傷或發生疾病時被啟用，才開始分裂。已經報導的含有幹細胞的成體組織包括：腦、骨髓、外周血液、血管、骨骼肌、面板、肝臟、肺和心臟等。大家所熟悉的幹細胞，如造血幹細胞、間充質幹細胞、神經幹細胞和心臟幹細胞等，都是屬於成體幹細胞。

理論上，成體幹細胞致瘤風險很低，而且所受倫理學爭議較少。數十年來,臨床上已有數十萬人接受了骨髓移植、外周血幹細胞移植和臍帶血移植,已清楚的證明了成體幹細胞在臨床應用上的安全性