董卓被殲滅以後，王允研究想要把董卓原來的部隊撤銷，當時有人就對王允說，此事萬萬不可，如果一旦撤銷，關中就必然會人人自危。王允不聽，當時百姓謠言，會將涼州人全部給誅殺掉，於是相互間恐懼騷動。在關中的，都擁兵自守並且相互間轉告說:“丁彥思，蔡伯喈只因為和董公交好，就都被株連獲罪。現在既然不赦免我們這些人，又想把部隊給撤銷，今天撤銷，明天我們就成了案板上的魚肉，任人宰割了啊。

董卓的部下李傕，郭汜等人先前駐軍在關東，因此心中不安，於是共同謀亂起兵叛亂，圍攻長安，長安城被攻破，呂布逃走。呂布在青瑣門下駐馬停下，招呼王允一同逃走。王允說:“如果得到皇上的保佑，上安國家，是我的願望。不然，就以身殉國。皇上幼小，靠大家一同輔佐。國家遇到災難，如果棄下皇上不管，獨自逃命，我實在是於心不忍啊。多多拜託關東的各路英雄豪傑，要以國家大事為重。”就扶著漢獻帝逃到了宣平城樓。李傕，郭汜也來到了宣平門下，向漢獻帝跪拜。漢獻帝壯著膽子質問他倆說，意欲何為。李傕回答說，只想替太師討回公道僅此而已。王允一句話都沒說，向漢獻帝行了最後的君臣禮節，就跟隨士兵走下了城樓，被李傕，郭汜命人處決了。王允卒年五十六歲。

王允最大的功勞就是和呂布一起收拾了董卓，可惜他位居三公，實際執政能力卻大大跟不上自己的官位。

殺死董卓之後，如果能換一個像曹操、諸葛亮張昭甚至賈詡那樣有能力的人來主持工作。三國後面的歷史就會完全改寫了。

可是作為實際上的執政者，王允既看不起呂布，又不願意把權力完全交給比他厲害的人，比如朱儁張楊或者賈詡。

最終導致董卓的部下越鬧越大，最後連王允自己也丟了腦袋。

當然最後的時刻他表現出的大無畏精神，值得肯定。呂布提著董卓的人頭，到城下招呼他一起離開，王允不願意一起逃。

所以說他這個人是忍辱負重，消滅了董卓；剛愎自用，擺平不了局面；深明大義，不願意苟且偷生。

綜上所述，王允其實是一位被自己害死了的英雄。