一、概念不同

1、臨床藥學：臨床藥學專業是2008年教育部審批設定的專業。臨床藥學是研究藥物防病治療的合理性和有效性的藥學學科。它主要內容是研究藥物在人體內代謝過程中發揮最高療效的理論與方法。它側重於藥物和人的關係，直接涉及到藥物本身，用藥物件和給藥方式，因此也直接涉及到醫療質量。

2、藥學：藥學專業（Pharmacy）是培養具備藥學學科基本理論、基本知識和實驗技能，能在藥品生產、檢驗、流通、使用和研究與開發領域從事鑑定、藥物設計、一般藥物製劑及臨床合理用藥等方面工作的高階科學技術人才的學科。

二、課程不同

1、臨床藥學：大學英語、高等數學、數理統計、醫用物理學、基礎化學、分析化學、有機化學、生物化學與分子生物學、臨床藥物代謝動力學、臨床見習、臨床藥理學、臨床藥物治療學、藥物不良反應與藥物警戒、藥物經濟學、醫院藥事法規與GCP、醫學倫理學、藥學資訊檢索等。

2、藥學：馬克思主義基本原理、思想道德修養、法律基礎、大學英語、高等數學、醫用物理學、計算機基礎、形態學概論、生理學、細胞生物學、分子生物學、醫學免疫學、病理生理學、醫學微生物學、藥物化學、天然藥物化學、藥劑學、藥物分析、藥理學、毒理學基礎、藥物的波譜解析、藥事管理學、專業技能實驗等。

三、核心能力不同

1、臨床藥學：基礎醫學、臨床醫學和藥學的基本理論知識；臨床合理用藥與安全用藥的基本理論知識；體液中藥物濃度測定的原理、方法與實驗技能；藥及藥物新劑型、新制劑的臨床藥理觀察與評價的初步能力。

2、藥學：掌握藥劑學、藥理學、藥物化學和藥物分析等學科的基本理論、基本知識；掌握主要藥物製備、質量控制、藥物與生物體相互作用、藥效學和藥物安全性評價等基本方法和技術；具有藥物製劑的初步設計能力、選擇藥物分析方法的能力、新藥藥理實驗與評價的能力、參與臨床合理用藥的能力。

四、就業方向不同

1、臨床藥學：臨床藥學專業的畢業生，其就業方向主要在各級醫療單位、醫學院校從事臨床藥學教育、藥品流通、藥品不良反應監測、藥品鑑定與研發、藥品服務與管理等工作。

2、藥學：藥學畢業主要從事藥品研究等。