2003年，劉玉棟再次帶領八一隊拿到了CBA的總冠軍，在總決賽結束後他選擇接受膝蓋手術，多年的傷病已經讓他無法堅持了。在劉玉棟受傷完成後，有記者聯絡到了八一主教練阿的江詢問劉玉棟的手術情況，阿的江說：“今天劉玉棟的手術剛剛做完，在膝蓋裡取出10塊碎骨頭來，以前一直以為只有兩三塊，真的不可思議。”阿的江表示和劉玉棟一起共事這麼多年，從來沒有想到他的傷情會這麼重。“10塊黃豆大小的碎骨頭在他膝蓋裡磨著，普通人連走路都困難，聽到這個訊息我的心裡不好受！”據說十塊碎骨頭被劉玉棟做成了標本，用來紀念他在籃球場上的戎馬半生。

劉玉棟是96黃金一代的代表性人物，他連續兩屆奧運會擔當旗手，是國家隊的絕對主力，八一隊的絕對核心。2005年他獲得了CBA十年貢獻獎，這也是CBA的最高榮譽，而劉玉棟也是實至名歸。

​身高1.98的劉玉棟籃球天賦並不出眾，但是他可以說是中國男籃歷史上最勤奮的球員，劉玉棟投籃精準，力量好，這些都是來源於他平時的刻苦訓練，在強手如林的八一隊，劉玉棟的表現非常搶眼，2001年九運會的決賽，面對姚明領銜的上海隊，劉玉棟在最後一秒晃過章文琪投的那記三分絕殺成為全運會歷史上最經典的進球。賽後姚明稱劉玉棟的這記進球就像巴頓將軍的子彈一樣，一擊斃命。

​2001-2002賽季，劉玉棟場均可以砍下37分，在對陣上海的時候，劉玉棟面對姚明的防守拿到了58分，也終結了上海的22連勝。總決賽上雖然八一隊惜敗上海，但是劉玉棟在那個系列賽上場均砍下41.5分，成為總決賽上表現最驚豔的球員，賽後他也被評為總決賽最有價值球員，在那個賽季，劉玉棟將得分王，常規賽最有價值球員，總決賽最有價值球員都收入囊中。

​劉玉棟在場上出色的表現讓他收穫了大量的球迷，他也有著戰神的美譽，劉玉棟不但受到了球迷的喜愛，也受到了籃球圈人士的認可，姚明在去NBA之後說道“鄧肯就像劉玉棟，馬刺像八一。”在退役的時候劉玉棟還特意提到了劉玉棟，他說在我心裡劉玉棟和八一一直是我非常尊敬的，他們見證了我的成長。八一男籃主帥阿的江在提到劉玉棟的時候說道“缺少了劉玉棟的八一隊比缺少了王治郅的八一隊還要艱難，中國可能100年之內可能都不會再出一個劉玉棟。”