不同的分類方法分為不同的界。
1.兩界系統（卡爾·林耐） 傳統的分類認為界是最高階的分類單位。在林奈時代，他以生物能否運動為標準，將生物劃分為兩界，即植物界和動物界。將細菌、真菌等都歸入植物界。
2.三界系統（赫克爾） 19世紀前後，由於顯微鏡的發明和使用，人們發現許多單細胞生物是有動、植物兩種屬性的中間型別的生物。如裸藻、甲藻等既可自養，有的也可異養生活。因而，赫克爾將原生生物（包括細菌、藻類、真菌和原生動物、黏菌等）另立為界，提出原生生物界、植物界、動物界的三界系統。
3.五界系統（魏泰克） 隨著電子顯微鏡技術的發展，生物學家發現細菌、藍藻細胞結構無核膜、無核仁及膜結構形成的細胞器，從而與其它真核細胞生物有顯著區別，應該另立為界。於是，1959年，魏泰克根據細胞結構的複雜程度及營養方式的不同，將細菌和藍藻、真菌從植物界中分出，分別另立為界，提出五界分類系統：原核生物界（包括細菌和藍藻等）、原生生物界 (單細胞真核生物)、植物界、真菌界和動物界，真核生物為後四界。
它們組成了一個縱橫統一的系統，從縱向上看，它顯示了生命歷史的三大階段：即原核單細胞階段、真核單細胞階段和真核多細胞階段（具有三個分支）。在橫向上看，它顯示了生物演化的三大方向：營光合自養的植物，為自然界的生產者；分解和吸收有機物的真菌，為自然界的分解者；以攝食有機物的方式進行營養的動物，為自然界的消費者（同時又是分解者）。
4.六界系統、三原界系統（伍斯） 分子生物學的發展，特別是rRNA 和rDNA的序列分析為整個生物界系統發育的研究提供了大量的資料。分子系統發育學已經表明，傳統的魏泰克五界系統並不完全代表生物的五個進化譜系。伍斯（Woese）和伍夫（Wolfe）提出原核生物在進化上有兩個重要分支，應將原核生物分為二界：古細菌界（甲烷菌、極嗜鹽菌和嗜熱嗜酸菌）和真細菌界（包括古細菌以外的其他原核生物，藍藻、真細菌等）。真核生物分四界（原生生物界、真菌界、動物界和植物界）。因此，提出六界分類系統。1990年，伍斯根據分子生物學的研究資料，對生物分類提出新的建議，認為整個生物界可以區分為三個獨立起源的大類群，即形成三個原界：古細菌原界、真細菌原界和真核生物原界。
不同的分類方法分為不同的界。
1.兩界系統（卡爾·林耐） 傳統的分類認為界是最高階的分類單位。在林奈時代，他以生物能否運動為標準，將生物劃分為兩界，即植物界和動物界。將細菌、真菌等都歸入植物界。
2.三界系統（赫克爾） 19世紀前後，由於顯微鏡的發明和使用，人們發現許多單細胞生物是有動、植物兩種屬性的中間型別的生物。如裸藻、甲藻等既可自養，有的也可異養生活。因而，赫克爾將原生生物（包括細菌、藻類、真菌和原生動物、黏菌等）另立為界，提出原生生物界、植物界、動物界的三界系統。
3.五界系統（魏泰克） 隨著電子顯微鏡技術的發展，生物學家發現細菌、藍藻細胞結構無核膜、無核仁及膜結構形成的細胞器，從而與其它真核細胞生物有顯著區別，應該另立為界。於是，1959年，魏泰克根據細胞結構的複雜程度及營養方式的不同，將細菌和藍藻、真菌從植物界中分出，分別另立為界，提出五界分類系統：原核生物界（包括細菌和藍藻等）、原生生物界 (單細胞真核生物)、植物界、真菌界和動物界，真核生物為後四界。
它們組成了一個縱橫統一的系統，從縱向上看，它顯示了生命歷史的三大階段：即原核單細胞階段、真核單細胞階段和真核多細胞階段（具有三個分支）。在橫向上看，它顯示了生物演化的三大方向：營光合自養的植物，為自然界的生產者；分解和吸收有機物的真菌，為自然界的分解者；以攝食有機物的方式進行營養的動物，為自然界的消費者（同時又是分解者）。
4.六界系統、三原界系統（伍斯） 分子生物學的發展，特別是rRNA 和rDNA的序列分析為整個生物界系統發育的研究提供了大量的資料。分子系統發育學已經表明，傳統的魏泰克五界系統並不完全代表生物的五個進化譜系。伍斯（Woese）和伍夫（Wolfe）提出原核生物在進化上有兩個重要分支，應將原核生物分為二界：古細菌界（甲烷菌、極嗜鹽菌和嗜熱嗜酸菌）和真細菌界（包括古細菌以外的其他原核生物，藍藻、真細菌等）。真核生物分四界（原生生物界、真菌界、動物界和植物界）。因此，提出六界分類系統。1990年，伍斯根據分子生物學的研究資料，對生物分類提出新的建議，認為整個生物界可以區分為三個獨立起源的大類群，即形成三個原界：古細菌原界、真細菌原界和真核生物原界。