BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途分別如下：

1、blastn是將給定的核酸序列與核酸資料庫中的序列進行比較。

2、blastp是使用蛋白質序列與蛋白質資料庫中的序列進行比較，可以尋找較遠的關係。

3、blastx則是將給定的核酸序列按照六種閱讀框架將其翻譯成蛋白質與蛋白質資料庫中的序列進行比對，對分析新序列和EST很有用。

4、tblastn將給定的氨基酸序列與核酸資料庫中的序列（雙鏈）按不同的閱讀框進行比對，對於尋找資料庫中序列沒有標註的新編碼區很有用。

5、tblastx只在特殊情況下使用，它將DNA被檢索的序列和核算序列資料庫中的序列按不同的閱讀框全部翻譯成蛋白質序列，然後進行蛋白質序列比對。

擴充套件資料

blast的主要特點就是：速度快，共線性輸出結果簡單易讀。對於比較小的序列（如 cDNA 等）對大基因組的比對，blast無疑是首選。

blast雖然效能優異，但是它自身也存在著一定的侷限性，對於特殊的任務需要注意選擇合適的軟體。例如blast用於遠親緣物種間的核酸序列比對時，比對精度就不夠高，建議使用專門為此用途開發的Blastz軟體。