基本性質：

國防軍是德國的正規軍，和納粹政府關係屬合作性質

黨衛軍是納粹武裝組織（嚴格來講不能算正規軍隊），和納粹政府關係為從屬關係

編制上：

德國國防軍屬於德國國防部

黨衛軍隸屬納粹黨，是納粹黨統治工具

政治上：

國防軍效忠於能夠代表德國國家利益的德國政府，誰上臺就效忠誰，不為任何黨派、組織或者個人服務，政治色彩很淡，魏瑪共和國時期國防軍普遍反對民主政府，但是仍然為其效忠。

黨衛軍僅代表納粹黨利益，納粹黨領袖是黨衛軍領導人。對希特勒來講黨衛軍比國防軍更加可靠。

職能上：

國防軍為爭取德國和德意志民族國家利益而戰

黨衛軍為爭取納粹黨利益而戰，也扮演憲兵和打手的角色剷除德軍中的異己分子

信仰上：

國防軍信奉國家利益至上和普魯士傳統軍人榮譽，在軍人榮譽的範圍內怎麼能代表德意志民族利益就怎麼做。

黨衛軍至始至終貫穿納粹擴張主義和種族歧視的教條。

外表上：

德國國防軍標誌為鷹徽

黨衛軍為本軍標誌（各支部隊不同，骷髏和閃電只是其中之一，還有如維京人旗幟、橡樹葉、彎刀和部隊成員原屬地的國旗等）

大致分類：

國防軍有陸軍、海軍和空軍（那時多數國家沒有空軍編制）

黨衛軍分黨衛隊（德華人和奧地利人）、SS志願部隊（非德國裔的日耳曼人和北歐人）以及武裝黨衛軍（德華人核心為骨幹，其他投奔的歐洲國家納粹信仰分子為主要構成）

軍官構成：

國防軍多普魯士舊貴族和軍官世家或者軍校出身的職業軍人

黨衛軍多納粹狂熱分子出身

二戰中的德國國防軍和黨衛軍有什麼區別？納粹德國的國防軍還是是屬於國家的軍隊，國防軍的成員還是忠於國家放在第一位。所以國防軍的內部有反希特勒的秘密組織。 黨衛隊則是納粹黨的軍隊，黨衛隊的成員把忠於黨放在第一位。並且負責完成消滅猶太人等國防軍不願意執行的任務。包括管理集中營的部隊，蓋世太保等等。1946年9月30日，紐倫堡軍事法庭的法官對黨衛隊組織作了判決，宣佈它是一個犯罪組織。