首頁>Club>
最近看到Environmental Science上掛著一篇文章:《What is Environmental Science?》內容翻譯過來大概是這樣的: 生物資訊學是計算機在生物資料管理中的應用。生物資訊學使用計算機來儲存,處理,分析,管理和檢索大量的生物和基因組資料。當應用於人類時,生物資訊學用於支援基於基因的藥物發現。當應用於野生動物和保護生物學時,它可能涉及管理毒理學家採集的血液和組織樣本資料,特定野生動植物群落的遺傳資訊,保護遺傳學或相關的生物多樣性資料。 生物資訊學專家是計算機科學家,他們將他們的知識應用於生物和基因組資料的管理。他們構建資料庫以包含資訊,編寫用於分析資訊的指令碼以及用於檢索資訊的查詢。
8
回覆列表
  • 1 # Tiger007

    我在這邊舉一個例子,就是所謂的化學分子指紋。這個也是生物資訊學的一個當前很火的應用。

    1 需要解決問題

    找出藥物中哪些成分和治療效果之間關係。

    2 解決問題思路

    2.1 定位分析物件

    藥物具有物理和化學效能,我們需要從二者來分析其具有的功效。對於威力特徵,包括其溶解度等,可以作為一個研究維度。另外就是從化學特點來分析。化學分析有原子和分子兩個層面,從原子層面來說,太過細碎,很難得到合理入手點,從分子層面來說,太過複雜,因此,應該從二者的中間層面,及可能起核心作用的功能團。對於功能團,需要從組分及結構兩個方面來考慮,

    2.1 尋找相關物件

    藥物和治療疾病之間是一種鏈式關係。 一般來說,是藥物分子—靶點大分子—生理效應(藥理效應/副作用)+ 藥物分為結構特異性與非結構特異性藥物,非結構特異性藥物透過理化性質發揮作用。如鋁碳酸鎂治胃病主要靠其酸鹼反應中和胃酸、鋁生成膠體的性質來形成胃黏膜保護層。結構特異性藥物主要透過與特定靶點作用產生生理效應,在病理條件下,這些生理效應就是藥理作用(如高血壓時降血壓、發燒時降體溫),但一個藥物往往不止一個作用靶點,一個靶點在不同的部位也可能發揮不同生理作用,因此在正常生理狀態的部位產生的額外的生理作用就會導致副總用。,因此,需要從這些有效藥物中確定這些功能團。功能團中,一些細小的組分差別(如可能某些原子)和一些簡單的結構差異(如苯環上對或者間連結的一個羥基和一個H原子(理解是對的,只是例子不太對) )可能對治療效果沒有本質影響,這些都需要作為相同/似功能團對待。

    2.3 問題解決過程

    第一步:確定不同藥物分子中有哪些組分和結構都相同/似的片段

    第二步:組分和結構都相同/似的片段怎樣劃分

    3、 AI方法應用解決

    藥物的繁多和分子的複雜,需要透過機器學習的方法來實現。 對於一個化學分子讓其組分和結構進行編碼,得到0,1組成的字串,然後利用頻繁項挖掘、聚類等演算法獲得有用的字串,透過逆編碼得到多個功能團,利用藥物專業分析得到其核心組分和重要有效結構,這就是化學分

  • 2 # 心理醫生巡診

    生物資訊學都研究什麼?這不是幾句話就能說清楚的,有興趣的朋友可以先百度初步瞭解一下,再具體聊您感興趣的領域。

  • 中秋節和大豐收的關聯?
  • 天氣熱了,孩子食慾變差了,有沒有什麼東西是可以提高孩子的食慾?