蛋白質的三級結構簡單的來說就是一條肽鏈的整體結構。首先我們知道蛋白質是由氨基酸組成的，而一定數量的氨基酸相互連結而成的也叫一條肽鏈，為什麼說蛋白質和肽鏈還不能完全等同呢，這是因為有的蛋白質不僅含有一條肽鏈，而是由多條肽鏈所組成的，我們把這種由數條肽鏈所構成的蛋白質的整體結構叫做蛋白質的四級結構。

而蛋白質的三級結構就好像把一條完整的肽鏈拿出來照個相，這一條完整肽鏈所具有的全部結構就叫做蛋白質的三級結構。對於只有一條肽鏈構成的蛋白質，其最高結構就是三級結構，而對於由多條肽鏈構成的蛋白質，多個三級結構組成的相對位置就是其四級結構。

其實蛋白質的四級結構分類是逐層遞進的，一級結構指的是組成肽鏈的氨基酸順序以及其中二硫鍵的位置，並不包括空間結構，而從二級結構開始，二級、三級、四級結構指的都是空間結構。只不過二級結構是一個區域性的反應，一如一條肽鏈在一個地方發生了螺旋（α-螺旋）或者一個摺疊（β-摺疊），那麼這種區域性空間結構就叫做蛋白質的二級結構。

所以我們可以看出來所謂的蛋白質三級結構只是我們對一整條肽鏈的空間分佈的描述而已，並不是什麼特殊的結構。

對於蛋白質的結構可以多讀幾遍生物化學，同時參考一些圖片，我相信能夠很快的理解清楚

蛋白質結構：一級結構：氨基酸殘基在蛋白質肽鏈中的排列順序稱為蛋白質的一級結構，每種蛋白質都有唯一而確切的氨基酸序列；

二級結構：蛋白質分子中肽鏈並非直鏈狀，而是按一定的規律捲曲或摺疊形成特定的空間結構。

三級結構：在二級結構的基礎上，肽鏈還按照一定的空間結構進一步形成更復雜的三級結構；

四級結構：具有三級結構的多肽鏈按一定空間排列方式結合在一起形成的聚集體結構稱為蛋白質的四級結構。如血紅蛋白由4個具有三級結構的多肽鏈構成。