1、最大的bug就是柯南自帶的去哪裡哪裡都有人死的光環，而恰巧的又是一個戴眼鏡的小學生看破了真相，又恰巧的是每次破案都有人被他扎針，更巧的是每個被他們扎完針睡覺的人都不追究為什麼會突然睡著，只有一個阿笠博士例外，可以不被扎針破案。

2、按照國內更新到952集來算，死的人至少估計有1000人+，一天破一個案子也快過了三年，現實中從2年級升到了3年級，每天不上課，天天跑出去催命。

3、神秘的夏威夷，樓上那位仁兄說的沒錯，在那裡新一學會了開車，開飛機（小型飛機），練過槍法，有一級裡竟然開客機迫降成功，小飛機和波音飛機 差別應該有的吧，竟然無縫學會小飛機就能開大飛機，只能說，死誰都不能死豬腳設定。

4、CIA水無憐奈近距離開槍擊中赤井秀一的頭顱，而且還把車弄爆炸了，秀一怎麼逃生的？事後臉上有燒傷痕跡，當初的確是在現場的，而且水無憐奈開槍是在琴酒監視命令下，秀一君就這樣死裡逃生了。

5、酒廠裡除了組織裡的人，潛伏了FBI，CIA，日本特高課的各種臥底，儼然就是一個臥底集中營，可憐我琴酒手下除了笨蛋就是叛徒。

6、各種各樣匪夷所思的殺人手法，有的的確是能做到，有的現實裡是無法複製的。

7、 現在流傳出來的最終boss 烏丸蓮耶的別墅，黃昏別館，一個通體用黃金打造的別墅，按照黃金的密度體積來計算，曾經百度有人分析了，估計比世界上任何一個國家的黃金儲備量都要大，這個也是極度不科學的。

8、柯南這個擁有絕對音感的唱歌五音不全的音痴一枚。絕對唱歌要人老命的。

9、怪盜基德和工藤新一的最終關係到底是什麼？沒記錯，貝爾摩德好像是跟黑羽盜一學習的易容術，但是工藤有希子也會易容術，而且關係也很好，關鍵兒子長得都一樣，對了，會不會黑羽快鬥是貝爾摩德的兒子，黑羽盜一和工藤優作是親兄弟，要麼再猥瑣點，快鬥就是新一失散多年的親兄弟，有希子大大，不是我故意想歪了，阿門。

10、還有例如某某博士沒有收入卻天天帶著一群小屁孩到處遊山玩水遇死人。有人會說博士發明和東西就有錢了，但是大部分發明出來的都沒啥用，可憐的阿笠博士。

11、柯南的滑板違反了萬有引力的規律了，太屌炸天的滑板，