除了出於覓食、繁殖或降溫的目的以外，陸生恐龍通常不會在水中。然而，中生代時期也有大量的海棲動物。蛇頸龍是一種長頸、有鰭的爬行動物。魚龍的外觀更像海豚，而滄龍則與體型厚實、有重疊鱗片的鰭鰻差相彷彿。 　　與其他許多海洋物種一樣，在白堊紀-第三紀滅絕事件中，蛇頸龍、魚龍等動物都滅絕了。生存至今的海洋物種中的的一些成員也經歷了重大損失。其中包括： 　　* 有孔蟲類，它們是帶殼的單細胞生物 　　* 棘皮類動物，包括海星，海膽，海參 　　* 身體柔軟、帶殼的軟體動物 　　但在白堊紀-第三紀滅絕事件後，這些生物和其他部分海洋物種最終緩過氣來，繼續繁衍發展，種類也變得更多。蛤，蝸牛，龍蝦，螃蟹和蝦也在滅絕事件中存活下來，最終成了海洋食肉動物的口中食，人類的盤中餐。在第一隻陸生恐龍在地面奔跑之前，鯊魚就已經在海洋裡生活了很久。時至今日，它們仍是海洋中最出名的食肉動物。 　　但有幾個物種則是某些早已滅絕的海洋生物門類中僅剩的倖存者。今天的八目鰻類魚和七鰓鰻與已經滅絕的甲冑魚類很相似。不過，可以追溯到中生代的海洋生物中，最有名的還要數腔棘魚，它們是水生肉鰭類動物的唯一倖存者。肉鰭魚是葉鰭、硬骨魚類。當然，世界上還有許多肉鰭類動物生存，不過它們早在中生代之前就已分化出來，變成了四足脊椎動物的祖先。 　　科學家認為腔棘魚在上世紀30年代才最終滅絕，所以也許有一天我們仍能發現其它從中生代生存至今的物種。