醫用酒精與碘酒的區別如下：

1、兩者的不要成份不同醫用酒精的主要成分是乙醇，並且它是混合物。醫用酒精是用澱粉類植物經糖化再發酵經蒸餾製成，相當於制酒的過程，但蒸餾溫度比酒低，蒸餾次數比酒多，酒精度高，製成品出量高，含酒精以外的醚、醛成分比酒多，不能飲用，但可接觸人體醫用。碘酒為紅棕色的液體，主要成分為碘、碘化鉀。有碘與乙醇特臭。色澤隨濃度增加而變深。適應症為用於面板感染和消毒。

2、兩者的消毒原理不同醫用酒精要使蛋白質變性，就要讓蜷曲、螺旋的蛋白質分子長鏈舒展、鬆弛，其中關鍵是破壞形成蜷曲和螺旋的各種力。酒精分子有兩個末端，一端是憎水的，可以破壞蛋白質內部憎水基團之間的吸引力；一端是親水的，但它難以破壞蛋白質外部的親水基團之間的吸引力。因碘酒具有氧化破壞病原體原漿蛋白的活性基因，並與蛋白質的氨基結合而使其變性沉澱，故具有強大的殺菌作用，對真菌、病毒和阿米巴原蟲也有殺滅作用，就連最不容易殺死的細菌芽孢，碘酊都能起到消毒作用，常見的如破傷風芽孢塗用碘酒後就可消滅它。

3、兩者的用法不同醫用酒精常用於擦拭紫外線燈。這種酒精在醫院常用，而在家庭中則只會將其用於相機鏡頭的清理。碘酒主要是細菌感染性面板病金黃色葡萄球菌易侵入毛囊，在毛囊口形成小膿皰，中央有毛髮穿過，俗稱毛囊炎。