氨基酸的共軛酸就是它的可解離基團全都質子化的形式，羧基不帶點，氨基等鹼性基團帶正電。 共軛酸鹼對是一對以質子得失關係聯絡起來的酸和鹼。根據酸鹼質子理論，酸和鹼總是對應存在，酸給出質子變成其共軛鹼，而鹼得到質子變成其相應的共軛酸，這種關係叫共軛關係。如醋酸(HAc)和醋酸根(Ac)、氨 (NH3)和銨離子(NH4+)等均為共軛酸鹼對。 根據布朗斯特德和勞萊的酸鹼質子理論，認為酸是能給出質子的物質，鹼是能接受質子的物質。酸失去質子，變成該酸的共扼鹼鹼得到質子後變成該鹼的共扼酸，有這種關係的酸鹼稱共扼酸鹼對。根據酸鹼的質子理論，酸或鹼可以是中性分子，也可以是陽離子或陰離子。既有酸的性質又有鹼的性質的物質稱為兩性物質，同理，具有酸的性質又有鹼的性質的溶劑為兩性溶劑。酸或鹼的失去質子或得到質子總是在某種溶劑中進行的，而兩性溶劑分子之間本身就能發生質子的轉移反應，即質子自遞作用。

二者的關係為：Ka x Kb = Kw = 10^(-14 )。 Ka是在室溫下（25°C）的弱酸的電離常數，Ka越大，酸性越強。Ka的計算方法為： Ka = [H+][A-]/[HA]; 而其共軛鹼的Kb表示在室溫下的鹼的電離常數，計算方法為：Kb = [HA][OH-]/[HA]; 兩者相乘化簡得，Ka x Kb = [H+][OH-] ，即水的離子積常數。因此Ka x Kb = [H+][OH-] = Kw = 10^(-14) （25攝氏度）。