首先,差異要列出清單.然後找出原因:正常損耗範圍內的計入管理費用; 非正常損耗的計入營業外支出(公司高層的審批手續). 超額的損耗處理還要上報稅務部門,可以諮詢當地地稅.

公司應該對庫存實存數進項定期或不定期全面盤點或抽盤，保證賬面庫存數和實際庫存數相同，如有差異，應該按以下步驟處理：

一、盤點，報告

財務部門和倉庫部門共同進行盤點，和賬面庫存數相比較，做盤盈盤虧表和報告。

二、查明原因

根據盤盈盤虧表的差異查詢原因，如果是提前入庫或出庫沒來的急入賬，應補齊相關手續及時入賬。如果是自然損耗、自然災害、還是管理不善等原因，在報經比准以前，將差額計入“待處理財產損益“科目。

盤虧：借：待處理財產損益

貸：庫存商品

盤盈：借: 庫存商品

貸：待處理財產損益

三、報公司審批核銷

根據查明的結果，報公司稽核核銷。

四、財務根據盤盈盤虧審批結果進行調賬

（1）、如果是盤盈，經批准後計入”管理費用“

盤盈：借: 貸處理財產損益

貸：管理費用

（2）、如果屬於自然損耗產生的定額內損耗，經批准後計入”管理費用“。

盤虧：借：管理費用

貸：貸處理財產損益

（3）、如果是由於室外損失或是自然災害損失，在扣除保險公司賠償後計入”營業外支出“。

盤虧： 借：其他應收款（保險賠款）

營業外支出

貸：待處理財產損益

（4）、如果是因為管理不善造成貨物被盜竊、發生黴爛變質等損失，扣除有關責任人賠償後計入”管理費用“。

盤虧：借：管理費用

其他應收款（相關責任人賠款）

貸： 待處理財產損益

另外要注意的是，非正常損失庫存的進項稅額不能抵扣，應該做進項稅額轉出。庫存損失金額較大的，要做專項申報，才能稅前列支，具體請詢問主管稅務局。