電子印章的申請使用電子印章的組織（或個人）首先需要到電子印章（管理）中心（平臺）申請電子印章，在履行完正常手續並確認無誤、合法的情況下，為申請者製作電子印章，並將製作好的電子印章匯入特定的儲存介質，如USB-Key或IC卡等，並提交給申請者。電子印章產品提供商給使用者提供電子印章的同時，還會提供一套電子印章客戶端系統。這套系統應該安裝在電子印章保管者所使用的終端電腦中。電子印章客戶端系統的主要作用就是用於進行蓋章、驗章以及電子印章管理等功能。電子印章的使用和傳統印章的使用方式基本相同。如上所述，首先需要有一臺專用的電子印章客戶端系統，該系統由電子印章管理平臺（電子印章中心）提供並安裝在特定的電腦終端上。 接下來的步驟一般是： (1)得到有關主管領導的批准。 (2)將存有電子印章的實體（如USBKey）插入電腦終端的USB介面。 (3)啟動電子印章客戶端系統。 (4)讀入需要加蓋電子印章的電子文書。 (5)在電子文書中需要蓋電子印章的地方點選選單上的‘蓋章’功能按鈕。 (6)系統提示輸入印章實體的pin碼。 (7)輸入正確的電子印章使用pin碼，則該文書就被蓋上電子印章了。 《電子簽名法》賦予電子印章法律效力之後，安全的電子印章將會逐步取代傳統印章，從而使電子檔案取代紙質檔案，這就可以實現應用流程的全程資訊化，可以實現真正的無紙辦公 驗證帶有電子印章的電子文書時，也需要裝有電子印章客戶端系統的終端電腦。當帶有電子印章的電子文書被開啟後，電子印章客戶端系統會自動驗證該電子文書的電子印章是否有效。如果電子文書被非授權修改過，或電子印章是被複制貼上在當前的電子文書上的，則電子印章客戶端系統能夠發現並立即警告使用者電子文書已被修改過或電子文書上所加蓋的是無效電子印章，且使得電子印章不能正常顯示，從而達到了保護電子文書的完整性以及檢驗電子印章和特定的電子文書必須是相關聯的目的。
電子印章的申請使用電子印章的組織（或個人）首先需要到電子印章（管理）中心（平臺）申請電子印章，在履行完正常手續並確認無誤、合法的情況下，為申請者製作電子印章，並將製作好的電子印章匯入特定的儲存介質，如USB-Key或IC卡等，並提交給申請者。電子印章產品提供商給使用者提供電子印章的同時，還會提供一套電子印章客戶端系統。這套系統應該安裝在電子印章保管者所使用的終端電腦中。電子印章客戶端系統的主要作用就是用於進行蓋章、驗章以及電子印章管理等功能。電子印章的使用和傳統印章的使用方式基本相同。如上所述，首先需要有一臺專用的電子印章客戶端系統，該系統由電子印章管理平臺（電子印章中心）提供並安裝在特定的電腦終端上。 接下來的步驟一般是： (1)得到有關主管領導的批准。 (2)將存有電子印章的實體（如USBKey）插入電腦終端的USB介面。 (3)啟動電子印章客戶端系統。 (4)讀入需要加蓋電子印章的電子文書。 (5)在電子文書中需要蓋電子印章的地方點選選單上的‘蓋章’功能按鈕。 (6)系統提示輸入印章實體的pin碼。 (7)輸入正確的電子印章使用pin碼，則該文書就被蓋上電子印章了。 《電子簽名法》賦予電子印章法律效力之後，安全的電子印章將會逐步取代傳統印章，從而使電子檔案取代紙質檔案，這就可以實現應用流程的全程資訊化，可以實現真正的無紙辦公 驗證帶有電子印章的電子文書時，也需要裝有電子印章客戶端系統的終端電腦。當帶有電子印章的電子文書被開啟後，電子印章客戶端系統會自動驗證該電子文書的電子印章是否有效。如果電子文書被非授權修改過，或電子印章是被複制貼上在當前的電子文書上的，則電子印章客戶端系統能夠發現並立即警告使用者電子文書已被修改過或電子文書上所加蓋的是無效電子印章，且使得電子印章不能正常顯示，從而達到了保護電子文書的完整性以及檢驗電子印章和特定的電子文書必須是相關聯的目的。