最基礎的反激式變壓器開關電源的簡單工作原理圖，在這一電路系統中，Ui是開關電源的輸入電壓，T是開關變壓器，K是控制開關，C是儲能濾波電容，R是負載電阻。下圖是反激式變壓器開關電源的電壓輸出波形。

開關電源變壓器和開關管一起構成一個自激（或他激）式的間歇振盪器，從而把輸入直流電壓調製成一個高頻脈衝電壓。在反激式電路中，當開關管導通時，變壓器把電能轉換成磁場能儲存起來，當開關管截止時則釋放出來。在正激式電路中，當開關管導通時，輸入電壓直接向負載供給並把能量儲存在儲能電感中。當開關管截止時，再由儲能電感進行續流向負載傳遞。

變壓器的初級電感量是202uH，參與耦合的卻只有200uH，那麼有2uH是漏感。次級是50uH，沒有漏感。變壓器的電感比是200：50，那麼意味著變壓器的匝比NP/NS=2：1設定瞬態掃描，時間10ms，步長10ns，穩態時的波形：

t0時刻，MOS開通，初級電流線性上升。 t1時刻，MOS關斷，初級感應電動勢耦合到次級向輸出電容轉移能量。漏感在MOS上產生電壓尖峰。輸出電壓透過繞組耦合，按照匝比關係反射到初級。這些和CCM模式時是一樣的。這一狀態維持到t2時刻結束。 t2時刻，次級二極體電流，也就是次級電感電流降到了零。這意味著磁芯中的能量已經完全釋放了。那麼因為二管電流降到了零，二極體也就自動截止了，次級相當於開路狀態，輸出電壓不再反射回初級了。由於此時MOS的Vds電壓高於輸入電壓，所以在電壓差的作用下，MOS的結電容和初級電感發生諧振。諧振電流給MOS的結電容放電。Vds電壓開始下降，經過1/4之一個諧振週期後又開始上升。由於RCD箝位電路的存在，這個振盪是個阻尼振盪，幅度越來越小。 t2到t3時刻，變壓器是不向輸出電容輸送能量的。輸出完全靠輸出的儲能電容來維持。 t3時刻，MOS再次開通，由於這之前磁芯能量已經完全釋放，電感電流為零。所以初級的電流是從零開始上升的。

要強調的是開關電源中的變壓器不是一般概念上的交流變壓器，因為它的激勵電壓不是正弦波，也不是50周市電，而是交變高頻脈衝波，其中的高次高頻諧波很豐富，所以設計這種變壓器時不能按低頻交流電變壓器方法設計，主要要考慮漏感，分佈電容的損耗，鐵芯也不能用矽鋼片，要用高頻磁芯，還要考慮導線的趨膚效應，不然，變壓器的溫升會造成變壓器過熱，可靠性降低，甚至燒燬。濾波電容也要特別的考慮，高頻損耗大，電解電容的損耗大不宜使用，否則容易降低電路的可靠性，也容易過熱使電解電容損壞。