無論原發性或繼發性膽總管結石並膽總管明顯擴張者，常有並存膽總管下端狹窄梗阻的可能。

術中探查證實膽總管下端明顯狹窄、梗阻者，應同時行膽腸內引流術，建立通暢的膽腸通道。（1）膽總管十二指腸吻合術。手術比較簡單、方便、易行，早期效果較好，過去常被採用。但因這一方法不可避免發生膽道反流或反流性膽管炎，反覆炎症容易導致吻合口狹窄，復發結石，遠期效果欠佳。特別是吻合口上端膽管存在狹窄或肝內膽管殘留結石未取淨者，往往反覆發生嚴重膽管炎或膽源性肝膿腫。因此，膽總管十二指腸吻合術今已少用。目前多主張僅用於年老、體弱、難以耐受較複雜的手術，並已明確吻合口以上膽管無殘留結石、無狹窄梗阻者。吻合口徑應在2 ～ 3cm 以上，防止日後回縮狹窄。（2）膽總管十二指腸間置空腸吻合術。將一段長20 ～ 30cm 帶血管的遊離空腸兩端分別與膽總管和十二指腸吻合，形成膽總管與十二指腸間用空腸架橋式的吻合通道。雖然在與十二指腸吻合處做成人工乳頭或延長空腸段達50 ～ 60cm，仍難以有效防止膽道反流，並易引起膽汁在間置空腸段內滯留、增加感染因素。手術過程也比較複雜，遠期效果和手術操作並不優於膽總管空腸吻合術。目前較少採用。（3）膽總管空腸Roux-en-Y 吻合術。利用空腸與膽總管吻合，容易實現3 ～ 5cm 以上的寬大吻合口，有利於防止吻合口狹窄。空腸的遊離度大、操作方便、靈活，尤其並存肝總管、肝門以上肝膽管狹窄或肝內膽管結石者，可以連續切開狹窄的肝門及左右肝管乃至Ⅲ級肝膽管，解除狹窄，取出肝內結石，建立寬暢的大口吻合。適應範圍廣、引流效果好。輔以各種形式的防反流措施，防止膽道反流和反流性膽管炎，是目前最常用的膽腸內引流術式。（4）Oddi 括約肌切開成形術。早年較多用於膽總管末端和乳頭狹窄患者，切開十二指腸，行Oddi 括約肌切開、成形。實際上如同低位膽總管十二指腸吻合，而且操作較十二指腸吻合複雜、較易發生再狹窄，遠期效果並不優於膽總管十二指腸吻合術。特別是近年來內鏡Oddi 括約肌切開術（EST）成功用於臨床和逐漸普及，不開腹、創傷小、受歡迎。適於Oddi 括約肌切開的病例，幾乎均可採用EST代替，並能獲得同樣效果，因此開腹Oddi 括約肌切開成形術已極少採用。（5）中西醫結合非手術治療。一般性膽管炎發作在有力的抗炎、保守治療過程中使用一些中藥方劑舒肝、利膽、解痙、止痛作為輔助治療，有一定效果。中西醫結合排石法，對於結石小、數量少、不伴膽管狹窄、Oddi 括約肌功能正常者，曾有排石成功的報道。但較大的結石不能排出，多髮結石難以排淨，並易再發。特別是明顯膽管梗阻併發重症膽管炎、不明結石數量和大小、是否存在膽管狹窄等情況下，經非手術治療，不能在短時間內緩解、好轉者，仍應及時進行膽總管手術探查引流，以免發展成嚴重的膽源性感染性休克等嚴重後果。