超高音速巡航導彈攔截要看是在哪個階段攔截了，最容易攔截的是初段攔截，由於導彈剛發射速度較低，軌跡容易判斷，所以比較好攔截，但是一般發射導彈都不容易發現，發現也不容易攔截（距離太遠），最常見的是中段攔截，洲際導彈中段一般飛行在大氣層外側，軌跡也較容易判斷，最難或者說不可能的是末端，垂直動能加發動機全功率加速，沒有時間去反應，而且好多巡航導彈為了提高生存率，會佈置分導彈頭或者虛假彈頭，使得導彈更加難攔截，末端攔截靠人品，哈哈

恐怕不能。即便是對付普通的彈道導彈，最佳時機也是早期發現，早期預警，在導彈剛發射或處於逐漸加速上升，速度低、彈道穩定的初級階段。中段或是末段，高超音速導彈再入大氣層，5～10馬赫、變軌、釋放誘餌假彈頭等，反導攔截幾乎已不可能了。

圖注：目前的遠端預警探測體系難以探測到高超聲速導彈

目前各國的反導系統主要是針對亞聲速巡航導彈和彈道導彈，對高超聲速巡航導彈攔截還沒有行之有效的方法。

高超聲速巡航導彈的飛行速度可達5馬赫以上，高速度飛行大大縮短了現有導彈預警探測系統的反應時間，現有攔截彈自身的飛行速度跟不上，因此攔截的難度非常大。同時其飛行高度在20千米至40千米之間，這一高度剛好處於防空攔截和反導攔截系統的盲區之間，只有“愛國者”導彈針對勉強能在這一區間進行攔截。此外，高超聲速導彈一般採用隱身外形設計，以減少雷達反射面積，達到突防目的。在飛行時機動過載較大，甚至還進行波浪式的跳躍機動，飛行軌跡難以跟蹤，相應的要求攔截彈也要具有很大的過載才行。

圖注：高超聲速巡航導彈的巡航高度是傳統防空反導系統的高度盲區

以上種種因素導致現有的防空反導攔截系統根本無法有效攔截高超聲速導彈，不過，各國正也在對相關技術進行研究，在未來很有可能會打造出一套專門攔截高超聲速導彈的反導系統。

從技術上看，高超聲速的飛行階段可分為助推段、慣性飛行段、巡航飛行段和末飛行段，其中助推段與彈道導彈的情況非常相似，如飛行速度相對較慢，飛行高度較低，紅外特徵明顯等等，因此在未來可以考慮借鑑採用機載鐳射武器系統、天基或臨近空間鐳射武器系統等方案進行攔截。

圖注：在受載飛行段，可以運用機載鐳射武器進行攔截。美國目前雖然暫停了ALTB專案，但對於機載鐳射武器相關技術研究仍在繼續

巡航飛行段雖然面臨雷達反射面積小、飛行速度大、飛行高度高的難點，但同時飛行時間長、射程遠、紅外特徵大，有效攔截機率較大，因此未來對高超聲速巡航導彈最有效的攔截時機就是在這一飛行段，不過，但現有的反導系統都面臨各種問題，未曾實施真正的相關攔截試驗，未來需要針對高超聲速巡航導彈的特點進一步提高效能，並採用適當的攔截、制導策略。