我認為No.10目暮警官嫌疑指數：★★☆名偵探柯南中不少事件都有目暮警官在場，而且常常草草了事，胡亂得出結論，而且與小五郎的胡亂推測配合的相當好，雖然表現得對柯南一副漠不關心的樣子，但可能在背地裡觀察他。強大的警力與強大的職權，也能為黑衣組織提供不少便利。No.9赤井秀一嫌疑指數：★★★雖然是FBI的調查員，但是表現的十分冷酷的樣子，或許是無法表現出熱情的樣子，很有老大的風範。而且槍法、推理能力都堪稱一流，所以說他是幕後黑手並不過分。No.8黑羽快鬥嫌疑指數：★★★☆著名的怪盜基德，喜歡偷東西然後再返還回去，人氣頗高。當小偷的原因是父親黑羽盜一被殺，快鬥想要找出真兇，所以成立了這樣一個組織（本來快鬥就很有錢的說）。徹底的除掉一些人，可以為自己提供不少便利（我不認為他會這麼做，應該是手下的人擅自行動的吧）。No.7黑羽盜一嫌疑指數：★★★☆黑羽盜一，怪盜基德（快鬥）的父親，據說在一次魔術表演中被殺，但我可不認為他這麼容易就會死掉。為了尋找寶石，得到永恆的壽命或是為了救人之類的，成立了黑衣組織，並在一次事故中佯裝死亡，幕後操縱黑衣組織活動。No.6鈴木園子嫌疑指數：★★★☆不多說了，有錢能使鬼推磨，鈴木財團的龐大資金可以解決一切。No.5吉田步美嫌疑指數：★★★☆不要被嬌小可愛的外表欺騙了，可能她就是幕後黑手。雖然柯南中有出現過，說貝爾摩德是“那個人”的戀人，但是誰規定女性之間就不能……或許步美從一開始就是喝藥變小的，然後潛伏在柯南周圍進行觀察，表現出的嬌弱與無能則是為了讓柯南放鬆警惕……No.4灰原哀嫌疑指數：★★★★APTX4869的開發者，由於決策的失誤，被迫吞下了變小藥。由於變小的身軀無法操控組織，只好在暗地裡進行操縱，所以柯南中並沒有出現任何黑衣組織Boss的訊息，因為這個Boss已經出現好幾次了！No.3工藤優作嫌疑指數：★★★★新一的父親，為了讓孩子體驗不一樣的人生，或者是為了積累自己的寫作素材，成立了黑衣組織。憑藉優作不劣於新一的推理能力，完全有可能掌控黑衣組織。No.2阿笠博士嫌疑指數：★★★★☆為什麼新一家附近會有這麼一個奇怪的博士？明明能發明出各種各樣實用的道具，卻不投放市場，這麼強大的頭腦，卻仍然沒有豪華的住宅，沒有得到國家重用。最有可能的是他就是黑衣組織的Boss，為了研究搞一些材料什麼的，覺得新一礙事就準備殺掉他，結果沒死反而變小了。但是變小的新一也對他造不成什麼威脅，所以放過他了。No.1毛利小五郎嫌疑指數：★★★★★從一些事件中可以看出，小五郎有著勝於新一（柯南）的推理能力，常日的瘋瘋癲癲只是表態，是為了讓人放鬆對自己的注意而故意裝出來的。新一（柯南）一直給他打麻醉針，而他連醫院也不去看看，足見嫌疑之大，而且槍法、格鬥技都堪稱一流，很有可能是黑衣組織的Boss。