1、非特異性免疫是生來就有，天生的免疫。所以也叫天然免疫；特異性免疫是出生後，機體與外來微生物的接觸後獲得的，所以也叫後天免疫或獲得性免疫。

2、故名思意，非特異性免疫缺乏特異性，即不針對某一種特定細菌或病毒，對任何外來入侵的微生物，反應方式都相似。相比之下，特異性免疫具有特異性，只針對某一種特定的微生物而產生。舉個例子，比如說，針對乙肝病毒的特異性免疫只針對乙肝病毒進行清除和中和，T淋巴細胞和B淋巴細胞可以發起強有利的細胞免疫反應和體液免疫反應（這兩種反應的有效性決定乙肝病毒能否完全清除），透過將感染的肝細胞完全溶解破壞，或非溶細胞過程將感染病毒的肝細胞清除。完全清除乙肝病毒最關鍵的是針對乙肝病毒特異性細胞免疫反應的啟用。

3、非特異性免疫由於生來就有，所以，反應方式有限。特異性免疫反應可以針對入侵微生物的不同，“定製”出具有高度特異性的免疫反應，針對特定的微生物，所以，具有與外界微生物的種類一樣豐富的多樣性。

4、特異性免疫有記憶功能，而非特異性免疫反應則沒有。大家知道，打了乙肝疫苗成功後，機體會產生免疫力。再次接觸乙肝病毒時，機體的特異性性免疫細胞就會發生回憶反應，對入侵的乙肝病毒發起特異性免疫攻擊，將病毒清除，阻止病毒感染。這種記憶功能是特異性免疫特有的。非特異性免疫沒有特異性，也就不存在記憶功能。

5、參與的免疫細胞不同。參與非特異性免疫反應的細胞主要是吞噬細胞，包括我們聽說過的巨噬細胞和血裡面的中性粒細胞，還有自然殺傷細胞（也叫NK細胞）。參與特異性免疫反應的細胞主要是淋巴細胞，包括T淋巴細胞和B淋巴細胞。

特異性免疫是有特異性的，只針對某一種病原體做出的免疫反應，要經過多種免疫細胞的作用。非特異性免疫沒有針對性。