1、指令性課題 各級政府主管部門考慮全域性或本地區醫藥衛生事業中迫切需要解決的問題，指定有關單位或個人必須在某一時段完成某一針對性很強的科研任務。這類課題具有行政命
令性質，因此稱為指令性醫學科研課題設計專案。這類課題的經費額度較大，但獲得指令性專案，必須具有雄厚的研究實力。如血吸蟲病防治課題，計劃生育課題等都屬此類課題。
2、指導性課題 指導性課題又稱招標性課題。國家有關部門根據醫藥衛生科學發展的需要，制定若干科研專案，引入競爭機制，採取公開招標方式落實計劃。在招標中，實行自由申報，同行專家評議，擇優資助。儘管對指導性課題申請者的職稱要求副高以上，但只要有兩名同行專家推薦，副高以下職稱者也可能獲得中標資格。指導性醫學科研課題設計主要有以下渠道。
（1）國家自然科學基金 國家科技部每年度頒發招標《專案指南》。有關醫藥衛生科學的主要類別如下：①面上專案：這類專案面廣、量大，佔所有資助的大部分。內容包括自由申請專案、青年科學基金專案、高技術專案與新概念、新構思探索專案。青年科學基金專案鼓勵35歲以下且具有較高學位或科研能力較強的年青人申報醫學科研課題設計。②重點專案：即指處於學科前沿並可能出現突破，具有重要意義的專案，此專案資助強度較大。③重大專案：即指理論與應用意義重大，目標明確，基礎堅實，可望在近期取得重大成果的專案。④新醫藥基礎性研究基金：用以資助新醫藥前期的關鍵基礎性研究和實驗。
（2）政府管理部門科研基金 國家、省市及地市科技、教育、衛生行政部門設定醫藥科學專用研究基金。主要資助應用性醫學科研課題設計，重點放在常見病、多發病、地方病和職業病的防治研究。
（3）單位科研基金 隨著醫療衛生事業的發展，各單位的市場意識和科研意識增強，均撥出一些經費用於科技開發。資助物件向年青人傾斜，重點資助起步性醫學科研課題設計，為下一步申請國家及與省級課題奠定基礎。
3、委託課題 委託課題來自於各級主管部門、大型廠礦企業和公司，委託單位的目的是看中受託單位的技術力量和裝置優勢，研製某項新產品、新技術和新方法，或測試分析某些產品的成份。某些跨國公司利用中國的資源，加大了在中國醫學藥學的研究投入，資助的力度較大。
4、自選課題 臨床醫學工作者，可以按照個人的專長與經驗，在自己崗位上根據本人或單位的需要與可能，自由地選擇研究課題。在基層單位，自選課題大有潛力可挖。例如試用一個新藥治療某病，就可有意識地比較新藥與原有同類藥物療效和副作用的差異，也可研究該藥與其它西藥或中藥聯合用藥的效應，還可研究該藥療效與不同性別、年齡段、病情、療程的關係…… 總之，只要開動腦筋，臨床醫學工作中的醫學科研課題設計是大有選擇空間的。
1、指令性課題 各級政府主管部門考慮全域性或本地區醫藥衛生事業中迫切需要解決的問題，指定有關單位或個人必須在某一時段完成某一針對性很強的科研任務。這類課題具有行政命
令性質，因此稱為指令性醫學科研課題設計專案。這類課題的經費額度較大，但獲得指令性專案，必須具有雄厚的研究實力。如血吸蟲病防治課題，計劃生育課題等都屬此類課題。
2、指導性課題 指導性課題又稱招標性課題。國家有關部門根據醫藥衛生科學發展的需要，制定若干科研專案，引入競爭機制，採取公開招標方式落實計劃。在招標中，實行自由申報，同行專家評議，擇優資助。儘管對指導性課題申請者的職稱要求副高以上，但只要有兩名同行專家推薦，副高以下職稱者也可能獲得中標資格。指導性醫學科研課題設計主要有以下渠道。
（1）國家自然科學基金 國家科技部每年度頒發招標《專案指南》。有關醫藥衛生科學的主要類別如下：①面上專案：這類專案面廣、量大，佔所有資助的大部分。內容包括自由申請專案、青年科學基金專案、高技術專案與新概念、新構思探索專案。青年科學基金專案鼓勵35歲以下且具有較高學位或科研能力較強的年青人申報醫學科研課題設計。②重點專案：即指處於學科前沿並可能出現突破，具有重要意義的專案，此專案資助強度較大。③重大專案：即指理論與應用意義重大，目標明確，基礎堅實，可望在近期取得重大成果的專案。④新醫藥基礎性研究基金：用以資助新醫藥前期的關鍵基礎性研究和實驗。
（2）政府管理部門科研基金 國家、省市及地市科技、教育、衛生行政部門設定醫藥科學專用研究基金。主要資助應用性醫學科研課題設計，重點放在常見病、多發病、地方病和職業病的防治研究。
（3）單位科研基金 隨著醫療衛生事業的發展，各單位的市場意識和科研意識增強，均撥出一些經費用於科技開發。資助物件向年青人傾斜，重點資助起步性醫學科研課題設計，為下一步申請國家及與省級課題奠定基礎。
3、委託課題 委託課題來自於各級主管部門、大型廠礦企業和公司，委託單位的目的是看中受託單位的技術力量和裝置優勢，研製某項新產品、新技術和新方法，或測試分析某些產品的成份。某些跨國公司利用中國的資源，加大了在中國醫學藥學的研究投入，資助的力度較大。
4、自選課題 臨床醫學工作者，可以按照個人的專長與經驗，在自己崗位上根據本人或單位的需要與可能，自由地選擇研究課題。在基層單位，自選課題大有潛力可挖。例如試用一個新藥治療某病，就可有意識地比較新藥與原有同類藥物療效和副作用的差異，也可研究該藥與其它西藥或中藥聯合用藥的效應，還可研究該藥療效與不同性別、年齡段、病情、療程的關係…… 總之，只要開動腦筋，臨床醫學工作中的醫學科研課題設計是大有選擇空間的。