一、性質不同

1、非特異投射系統：彌散性的感覺投射系統。

2、特異投射系統：丘腦特異感覺接替核及其投射至大腦皮層的神經通路。

二、作用不同

1、非特異投射系統：透過腦幹時發出側支，與腦幹網狀結構的神經元發生突觸聯絡，然後在網狀結構內反覆換元上行，到達丘腦內側部分的核群，彌散性地投射至大腦皮層的廣泛區域。

2、特異投射系統：它們投向大腦皮層的特定區域，具有點對點的投射關係。投射纖維主要終止於皮層的第四層，形成絲球結構，與該層內神經元構成突觸聯絡，引起特定的感覺。

三、特點不同

1、非特異投射系統的特點：

這是一切感覺傳入的共同通道，也就是說，當各種感覺輸入透過側枝進入腦幹網狀結構時，它們不再透過特定的傳導途徑，而是透過一個共同的向上傳導系統和它們的脈衝來傳遞。在大腦皮層的作用中失去特異性。對維持與改變大腦皮層的興奮性和覺醒狀態有重要作用。

2、特異投射系統特點：

另外，這些投射纖維還透過若干中間神經元接替，與大錐體細胞構成突觸聯絡，這些中間神經元刺激皮層發出傳出脈衝。大多數的接觸核在結構上也與大腦皮層有關，因此它們也包含在系統中。

擴充套件資料

特異性投射系統 :特異性投射系統是指從丘腦發出的纖維，投射到大腦皮層的特定區域，具有程度很高的點對點的投射關係。 特異性投射系統的功能是傳遞精確的資訊到大腦皮層引起特定的感覺，並激發大腦皮層發出傳出神經衝動。 非特異性投射系統 :特異性投射系統的第二級神經元的部分纖維或側支進入腦幹網狀結構，與其內的神經元發生廣泛地突觸聯絡，並逐漸上行，抵達丘腦內側部，然後進一步彌散性投射到大腦皮層的廣泛區域。所以，這一感覺投射系統失去了專一的特異性感覺傳導功能，是各種不同感覺的共同上傳途徑。又稱為非特異性投射系統