挺多的，本人能力有限，能看到的修改有以下幾處：

電視劇刪去了劉令嫻、徐燕宜、胡蘊蓉等原著中為皇上嬪妃的女性角色；

電視劇刪去了甄嬛的哥哥甄衍，原著中安陵容對甄衍暗生情愫，所以入宮後不願邀寵。以及與甄衍有關的一切支線劇情也就都沒有出現，這些在原著中有不少篇幅的描寫；

電視劇皇上是雍正，所以皇家的名字都改掉了，什麼允禮啊允禧啊，原著是架空的，皇上的名字叫玄凌，果郡王在原著中叫玄清（清河王），允禧叫玄胤；

電視劇中沈眉莊和溫實初生的是女兒，原著中生的是兒子，並且這個兒子由甄嬛撫養長大後成為皇帝；

電視劇中四阿哥弘曆被甄嬛撫養後成為皇帝，原著中沒有這個人物；

電視劇中甄嬛回宮後封號是熹妃，原著中是淑妃；

電視劇中華妃的名字是年世蘭，哥哥叫年羹堯，原著中華妃叫慕容世蘭，慕容迥（華妃的父親）、慕容世松、慕容世柏（華妃的兄弟）後面還有一個妹妹叫慕容世芍（電視劇中沒有出現），開始是一個婢女，叫“赤芍”，後來也進了位分，但是最後還是死了；

電視劇中褀嬪的名字是瓜爾佳·文鳶，原著中叫管文鳶；

電視劇中皇上身邊的太監總管叫蘇培盛，原著中叫李長；

電視劇中皇后、純元皇后和太后是烏拉那拉氏，原著中是朱氏；

電視劇中馴獸女葉瀾依的封號是寧嬪，在王爺死後給皇上下慢性藥，皇上駕崩後她殉情而死。原著中她的封號是灩嬪，在王爺死後她行刺皇上未果被五馬分屍了；

電視劇中曹琴默被封為襄嬪後被太后一碗毒藥搞定了，原著中是下得慢性藥，夜夜夢魘後瘋癲而死；

電視劇中甄嬛與王爺生下的女兒叫靈犀，原著中叫雪魄。